23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2843 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013502  Rmar_2843  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  331  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000164273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3400  hypothetical protein  40.13 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000709741  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1023  protein of unknown function DUF1130  36.75 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  32.3 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  27.33 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  28.75 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1162  hypothetical protein  26.79 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0955  hypothetical protein  28.3 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0251  hypothetical protein  27.67 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5517  hypothetical protein  25.97 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1029  hypothetical protein  23.87 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14565  normal  0.606102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5361  hypothetical protein  27.45 
 
 		 147 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4240  hypothetical protein  25.69 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0072533  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  25 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  28.08 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  26.32 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  23.81 
 
 		 297 aa  44.3  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1743  protein of unknown function DUF1130  26.25 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4723  protein of unknown function DUF1130  25.16 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264076  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  26.49 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  25.17 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4268  protein of unknown function DUF1130  23.68 
 
 		 150 aa  42  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  24.36 
 
 		 166 aa  40.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>