36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3400 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3400  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  326  7e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000709741  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1023  protein of unknown function DUF1130  64.29 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2843  hypothetical protein  40.13 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000164273  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  30.38 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  30.38 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1162  hypothetical protein  26.32 
 
 		 284 aa  52.4  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1029  hypothetical protein  28.14 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14565  normal  0.606102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4268  protein of unknown function DUF1130  33.76 
 
 		 150 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  29.8 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5517  hypothetical protein  32.89 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  30.63 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  29.73 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3900  hypothetical protein  33.12 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  33.1 
 
 		 191 aa  47.4  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5361  hypothetical protein  32.89 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4371  protein of unknown function DUF1130  33.33 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2773  hypothetical protein  28.22 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000099126  unclonable  0.000000140227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  28.21 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  22.58 
 
 		 298 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4723  protein of unknown function DUF1130  32.89 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264076  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  29.38 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  25.48 
 
 		 297 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0955  hypothetical protein  30.57 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1743  protein of unknown function DUF1130  28.12 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0922  hypothetical protein  29.81 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6081  protein of unknown function DUF1130  32.68 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1026  hypothetical protein  55.56 
 
 		 48 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.978644  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4240  hypothetical protein  30.28 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0072533  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  31.01 
 
 		 224 aa  42  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  30.82 
 
 		 195 aa  42  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  30.19 
 
 		 351 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  22.78 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0781  hypothetical protein  29.17 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.588126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  30.56 
 
 		 177 aa  40.8  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1081  hypothetical protein  22.58 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3408  hypothetical protein  27.5 
 
 		 307 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>