14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1023 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1023  protein of unknown function DUF1130  100 
 
 		 142 aa  289  8e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3400  hypothetical protein  64.29 
 
 		 161 aa  160  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000709741  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2843  hypothetical protein  36.75 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000164273  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4268  protein of unknown function DUF1130  37.1 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3900  hypothetical protein  36.29 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5517  hypothetical protein  35.59 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4371  protein of unknown function DUF1130  35.48 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5361  hypothetical protein  34.88 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  27.05 
 
 		 298 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  34 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  34.65 
 
 		 224 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  32.33 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  26.09 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>