73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1898 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1898  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  300  7.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0934802  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  62.14 
 
 
143 aa  171  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  54.69 
 
 
151 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  45.33 
 
 
153 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  50.76 
 
 
166 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0251  hypothetical protein  46.1 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  44.9 
 
 
154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  42.76 
 
 
167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5517  hypothetical protein  47.92 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  43.51 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4371  protein of unknown function DUF1130  48.95 
 
 
150 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.201417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4268  protein of unknown function DUF1130  48.25 
 
 
150 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3900  hypothetical protein  46.85 
 
 
150 aa  103  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  43.18 
 
 
160 aa  103  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5361  hypothetical protein  45.14 
 
 
147 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  38.89 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6081  protein of unknown function DUF1130  50.34 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0516  hypothetical protein  46.26 
 
 
176 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597563  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0922  hypothetical protein  41.54 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  37.41 
 
 
297 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4723  protein of unknown function DUF1130  40.91 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264076  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0773  protein of unknown function DUF1130  35.25 
 
 
294 aa  78.2  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  28.08 
 
 
298 aa  77  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2775  hypothetical protein  36.07 
 
 
159 aa  77  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1162  hypothetical protein  28.87 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4240  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0072533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2617  protein of unknown function DUF1130  37.41 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.727406  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  35.21 
 
 
195 aa  67.8  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3417  hypothetical protein  30.41 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  31.5 
 
 
351 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  30.6 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0956  hypothetical protein  30.19 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  34.25 
 
 
224 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0017  hypothetical protein  38.78 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  31.25 
 
 
190 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4520  hypothetical protein  31.58 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  31.79 
 
 
186 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  32.17 
 
 
191 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  30.99 
 
 
182 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3471  hypothetical protein  33.83 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.646682  normal  0.0531544 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4695  protein of unknown function DUF1130  32.86 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0878626  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  28.36 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  30 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1029  hypothetical protein  31.58 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14565  normal  0.606102 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0033  protein of unknown function DUF1130  31.51 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  29.37 
 
 
177 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  28.1 
 
 
180 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2268  hypothetical protein  30.56 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3408  hypothetical protein  32.85 
 
 
307 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0015  hypothetical protein  30.82 
 
 
183 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1257  hypothetical protein  22.3 
 
 
204 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000444267  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  25.38 
 
 
199 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000271396  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1069  hypothetical protein  20.95 
 
 
204 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000104806  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1081  hypothetical protein  25.18 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0124  hypothetical protein  30.43 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1743  protein of unknown function DUF1130  27.46 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  27.14 
 
 
191 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  27.14 
 
 
191 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2774  hypothetical protein  33.59 
 
 
209 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670042  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3108  hypothetical protein  38.46 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0971254  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0743  hypothetical protein  29.7 
 
 
319 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1153  protein of unknown function DUF1130  28.26 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.908122 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3555  protein of unknown function DUF1130  33.58 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0626  protein of unknown function DUF1130  25.71 
 
 
194 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2160  hypothetical protein  34.78 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4534  protein of unknown function DUF1130  30.77 
 
 
181 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360408  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0793  hypothetical protein  26.09 
 
 
198 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3526  hypothetical protein  25.36 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30420  hypothetical protein  31.54 
 
 
199 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.711369  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1460  hypothetical protein  31.13 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  27.54 
 
 
185 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2773  hypothetical protein  30.53 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000099126  unclonable  0.000000140227 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1437  hypothetical protein  30.07 
 
 
224 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>