57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0743 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0743  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  652    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  54.29 
 
 
351 aa  326  3e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2268  hypothetical protein  61.6 
 
 
162 aa  168  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124459 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1460  hypothetical protein  45.8 
 
 
173 aa  95.1  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  38.89 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  38.1 
 
 
186 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  36.89 
 
 
185 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1153  protein of unknown function DUF1130  35.77 
 
 
195 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.908122 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4905  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.556359  normal  0.961888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3461  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  32.54 
 
 
178 aa  58.9  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5381  hypothetical protein  33.08 
 
 
194 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782244  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4337  hypothetical protein  33.08 
 
 
192 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0844376  hitchhiker  0.00670192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  34.51 
 
 
190 aa  56.2  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4854  hypothetical protein  32.33 
 
 
192 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.0401842 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  34.68 
 
 
191 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  34.68 
 
 
191 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4695  protein of unknown function DUF1130  35.83 
 
 
180 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0878626  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  33.82 
 
 
224 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  37.27 
 
 
151 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  30.83 
 
 
180 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30420  hypothetical protein  32.85 
 
 
199 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.711369  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4520  hypothetical protein  30 
 
 
176 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3408  hypothetical protein  38.52 
 
 
307 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0956  hypothetical protein  38.1 
 
 
198 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0793  hypothetical protein  31.58 
 
 
198 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  35.29 
 
 
154 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4534  protein of unknown function DUF1130  39.02 
 
 
181 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360408  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  34.17 
 
 
177 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3471  hypothetical protein  39.22 
 
 
197 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.646682  normal  0.0531544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0251  hypothetical protein  34.45 
 
 
148 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3526  hypothetical protein  36.59 
 
 
177 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0017  hypothetical protein  36.76 
 
 
177 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  36.44 
 
 
154 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  32.54 
 
 
182 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  33.61 
 
 
153 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2774  hypothetical protein  36.67 
 
 
209 aa  49.3  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670042  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0033  protein of unknown function DUF1130  34 
 
 
183 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0796  protein of unknown function DUF1130  33.33 
 
 
176 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  29.13 
 
 
160 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4634  hypothetical protein  32.59 
 
 
178 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4341  hypothetical protein  32.59 
 
 
178 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.127657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4255  hypothetical protein  32.59 
 
 
178 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  28.95 
 
 
167 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  28.33 
 
 
298 aa  46.2  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  29.63 
 
 
143 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0015  hypothetical protein  34 
 
 
183 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30650  hypothetical protein  28.87 
 
 
196 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  29.51 
 
 
153 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  31.53 
 
 
166 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  30.6 
 
 
191 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1437  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  44.3  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3801  hypothetical protein  30.22 
 
 
154 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1898  hypothetical protein  29.7 
 
 
149 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0934802  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1426  protein of unknown function DUF1130  35.54 
 
 
184 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000439309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5361  hypothetical protein  30.58 
 
 
147 aa  42.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0567423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>