61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30650 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_30650  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  392  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4255  hypothetical protein  56.9 
 
 
178 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4341  hypothetical protein  56.9 
 
 
178 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.127657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4634  hypothetical protein  56.9 
 
 
178 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0796  protein of unknown function DUF1130  55.37 
 
 
176 aa  180  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1426  protein of unknown function DUF1130  55.23 
 
 
184 aa  164  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000439309  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30420  hypothetical protein  48.62 
 
 
199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.711369  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2160  hypothetical protein  52.35 
 
 
169 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3801  hypothetical protein  56.38 
 
 
154 aa  155  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1437  hypothetical protein  48.04 
 
 
224 aa  154  9e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  39.53 
 
 
185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  41.67 
 
 
177 aa  118  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4695  protein of unknown function DUF1130  39.43 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0878626  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0017  hypothetical protein  41.24 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  37.99 
 
 
191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3417  hypothetical protein  37.5 
 
 
171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  37.99 
 
 
191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1153  protein of unknown function DUF1130  42.7 
 
 
195 aa  110  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.908122 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  35.06 
 
 
178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4534  protein of unknown function DUF1130  40.13 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360408  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  36.63 
 
 
182 aa  108  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  39.26 
 
 
190 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4337  hypothetical protein  34.08 
 
 
192 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0844376  hitchhiker  0.00670192 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4854  hypothetical protein  34.08 
 
 
192 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.0401842 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3526  hypothetical protein  37.79 
 
 
177 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0793  hypothetical protein  34.64 
 
 
198 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  36.75 
 
 
177 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  36.97 
 
 
191 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5381  hypothetical protein  34.3 
 
 
194 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782244  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3471  hypothetical protein  41.24 
 
 
197 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.646682  normal  0.0531544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  34.66 
 
 
224 aa  99.4  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  33.72 
 
 
180 aa  98.6  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4905  hypothetical protein  33.72 
 
 
194 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.556359  normal  0.961888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3461  hypothetical protein  33.72 
 
 
194 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4520  hypothetical protein  30.64 
 
 
176 aa  91.7  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  32.18 
 
 
178 aa  87.8  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3408  hypothetical protein  38.1 
 
 
307 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  30.54 
 
 
186 aa  84.3  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3555  protein of unknown function DUF1130  39.26 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3491  protein of unknown function DUF1130  39.26 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0033  protein of unknown function DUF1130  36.57 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0015  hypothetical protein  36.57 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  31.68 
 
 
351 aa  62  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3108  hypothetical protein  38.71 
 
 
106 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0971254  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0317  hypothetical protein  32.97 
 
 
102 aa  57.4  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000191328  decreased coverage  0.00259322 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  29.37 
 
 
199 aa  55.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000271396  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2774  hypothetical protein  28.05 
 
 
209 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670042  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  30.57 
 
 
195 aa  54.7  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0654  protein of unknown function DUF1130  24.18 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0956  hypothetical protein  30.14 
 
 
198 aa  48.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  26.62 
 
 
167 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  26.81 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1162  hypothetical protein  28.1 
 
 
284 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1257  hypothetical protein  23.38 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000444267  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1069  hypothetical protein  22.08 
 
 
204 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000104806  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0743  hypothetical protein  28.87 
 
 
319 aa  45.4  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1460  hypothetical protein  30.61 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1081  hypothetical protein  23.87 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  25.87 
 
 
154 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0516  hypothetical protein  25.77 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  32.39 
 
 
297 aa  42  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>