61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2160 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2160  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  334  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4634  hypothetical protein  62.5 
 
 
178 aa  200  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4341  hypothetical protein  62.5 
 
 
178 aa  200  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.127657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4255  hypothetical protein  62.5 
 
 
178 aa  200  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1426  protein of unknown function DUF1130  61.08 
 
 
184 aa  183  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000439309  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0796  protein of unknown function DUF1130  55.36 
 
 
176 aa  176  9e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30650  hypothetical protein  52.35 
 
 
196 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3801  hypothetical protein  55.86 
 
 
154 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1437  hypothetical protein  52.38 
 
 
224 aa  154  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30420  hypothetical protein  47.31 
 
 
199 aa  138  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.711369  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  39.41 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  38.69 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  37.2 
 
 
177 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1153  protein of unknown function DUF1130  40 
 
 
195 aa  105  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.908122 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  40 
 
 
224 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  34.52 
 
 
178 aa  103  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4534  protein of unknown function DUF1130  44.62 
 
 
181 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360408  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  37.06 
 
 
185 aa  98.6  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  36.9 
 
 
180 aa  98.6  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  36.3 
 
 
177 aa  97.8  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0017  hypothetical protein  39.64 
 
 
177 aa  97.4  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4905  hypothetical protein  35.12 
 
 
194 aa  94  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.556359  normal  0.961888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3461  hypothetical protein  35.12 
 
 
194 aa  94  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0793  hypothetical protein  33.93 
 
 
198 aa  93.6  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  34.73 
 
 
190 aa  93.6  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3526  hypothetical protein  35.09 
 
 
177 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4520  hypothetical protein  36.43 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5381  hypothetical protein  34.52 
 
 
194 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782244  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  33.93 
 
 
191 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  32.1 
 
 
186 aa  90.1  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  33.93 
 
 
191 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  34.33 
 
 
191 aa  87.4  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4695  protein of unknown function DUF1130  35.5 
 
 
180 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0878626  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3417  hypothetical protein  30.54 
 
 
171 aa  85.9  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4337  hypothetical protein  31.55 
 
 
192 aa  84.3  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0844376  hitchhiker  0.00670192 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4854  hypothetical protein  32.14 
 
 
192 aa  84.3  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.0401842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0033  protein of unknown function DUF1130  36.09 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0015  hypothetical protein  36.31 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3471  hypothetical protein  36.88 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.646682  normal  0.0531544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2774  hypothetical protein  36.31 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670042  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  33.75 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3408  hypothetical protein  37.11 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0317  hypothetical protein  36.05 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000191328  decreased coverage  0.00259322 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3555  protein of unknown function DUF1130  37.11 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  34.21 
 
 
195 aa  67  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3491  protein of unknown function DUF1130  37.11 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3108  hypothetical protein  37.5 
 
 
106 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0971254  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1081  hypothetical protein  23.53 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  28.17 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1257  hypothetical protein  23.97 
 
 
204 aa  52  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000444267  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  24.14 
 
 
199 aa  51.6  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000271396  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0743  hypothetical protein  31.69 
 
 
319 aa  48.5  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1069  hypothetical protein  21.92 
 
 
204 aa  48.5  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000104806  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1898  hypothetical protein  35.65 
 
 
149 aa  45.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0934802  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  27.07 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  30.16 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0956  hypothetical protein  28.91 
 
 
198 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1742  hypothetical protein  29.17 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2775  hypothetical protein  25.6 
 
 
159 aa  41.2  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  28.79 
 
 
166 aa  40.8  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0118609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>