47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3308 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3308  protein of unknown function DUF1130  100 
 
 
68 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  0.526797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0956  hypothetical protein  56.9 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4695  protein of unknown function DUF1130  50.82 
 
 
180 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0878626  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0626  protein of unknown function DUF1130  47.46 
 
 
194 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  35.48 
 
 
195 aa  57  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3461  hypothetical protein  45.9 
 
 
194 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4905  hypothetical protein  45.9 
 
 
194 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.556359  normal  0.961888 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5381  hypothetical protein  45.9 
 
 
194 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782244  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  40.98 
 
 
178 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  46.43 
 
 
185 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0793  hypothetical protein  42.62 
 
 
198 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  49.12 
 
 
191 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4854  hypothetical protein  40.98 
 
 
192 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.0401842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3417  hypothetical protein  42.11 
 
 
171 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  40.98 
 
 
190 aa  52.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  41.38 
 
 
186 aa  52.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  42.62 
 
 
191 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  44.83 
 
 
224 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4337  hypothetical protein  40.98 
 
 
192 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0844376  hitchhiker  0.00670192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  42.62 
 
 
191 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  41.94 
 
 
177 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  43.86 
 
 
177 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4520  hypothetical protein  42.11 
 
 
176 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3526  hypothetical protein  40.98 
 
 
177 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  40 
 
 
199 aa  50.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000271396  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2774  hypothetical protein  40.68 
 
 
209 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670042  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1257  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000444267  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0015  hypothetical protein  39.66 
 
 
183 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0033  protein of unknown function DUF1130  39.66 
 
 
183 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1069  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000104806  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3108  hypothetical protein  42.11 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0971254  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0317  hypothetical protein  39.34 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000191328  decreased coverage  0.00259322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4534  protein of unknown function DUF1130  36.07 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360408  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  39.29 
 
 
180 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  40.98 
 
 
182 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0017  hypothetical protein  40.62 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0654  protein of unknown function DUF1130  43.14 
 
 
208 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  36.92 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  37.29 
 
 
178 aa  43.5  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5517  hypothetical protein  31.15 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1153  protein of unknown function DUF1130  36.07 
 
 
195 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.908122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0796  protein of unknown function DUF1130  36.07 
 
 
176 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  37.93 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4634  hypothetical protein  31.75 
 
 
178 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4341  hypothetical protein  31.75 
 
 
178 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.127657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4255  hypothetical protein  31.75 
 
 
178 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6081  protein of unknown function DUF1130  31.15 
 
 
147 aa  40.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>