59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0317 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0317  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  207  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000191328  decreased coverage  0.00259322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4534  protein of unknown function DUF1130  53.61 
 
 
181 aa  113  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360408  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  48.48 
 
 
190 aa  92  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3417  hypothetical protein  46 
 
 
171 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  47.92 
 
 
191 aa  90.1  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  46.88 
 
 
177 aa  87  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  43.75 
 
 
177 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4520  hypothetical protein  43.3 
 
 
176 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  43.3 
 
 
191 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  43.3 
 
 
191 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  42.55 
 
 
178 aa  79  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  42.55 
 
 
224 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  43.3 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  44.55 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1153  protein of unknown function DUF1130  41.3 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.908122 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3408  hypothetical protein  43.16 
 
 
307 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3471  hypothetical protein  41.67 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.646682  normal  0.0531544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3108  hypothetical protein  43.01 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0971254  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3526  hypothetical protein  41.67 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4854  hypothetical protein  41.24 
 
 
192 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.0401842 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0015  hypothetical protein  41.67 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4337  hypothetical protein  41.24 
 
 
192 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0844376  hitchhiker  0.00670192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  42.55 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0033  protein of unknown function DUF1130  41.67 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3555  protein of unknown function DUF1130  40 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0796  protein of unknown function DUF1130  38.71 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4255  hypothetical protein  38.54 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  40.4 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4341  hypothetical protein  38.54 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.127657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4634  hypothetical protein  38.54 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  43.96 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0793  hypothetical protein  40.21 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1426  protein of unknown function DUF1130  37.5 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000439309  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3461  hypothetical protein  40.21 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4905  hypothetical protein  40.21 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.556359  normal  0.961888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2160  hypothetical protein  36.05 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4695  protein of unknown function DUF1130  43.75 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0878626  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5381  hypothetical protein  40.21 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782244  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1437  hypothetical protein  37.89 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0956  hypothetical protein  45.59 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3491  protein of unknown function DUF1130  38.95 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0017  hypothetical protein  38.14 
 
 
177 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30420  hypothetical protein  35.42 
 
 
199 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.711369  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30650  hypothetical protein  32.97 
 
 
196 aa  57.4  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1069  hypothetical protein  36.67 
 
 
204 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000104806  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3801  hypothetical protein  42.19 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2774  hypothetical protein  40.3 
 
 
209 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670042  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1257  hypothetical protein  35 
 
 
204 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000444267  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  32 
 
 
195 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1081  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0654  protein of unknown function DUF1130  37.5 
 
 
208 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  32.86 
 
 
199 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000271396  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3308  protein of unknown function DUF1130  39.34 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  0.526797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  31 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  33 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  30.3 
 
 
153 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0626  protein of unknown function DUF1130  29.17 
 
 
194 aa  41.6  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  29.29 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0251  hypothetical protein  28.57 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.319712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>