57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3801 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3801  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  303  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0796  protein of unknown function DUF1130  64.86 
 
 		 176 aa  190  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1426  protein of unknown function DUF1130  62.84 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000439309  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4634  hypothetical protein  57.93 
 
 		 178 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4341  hypothetical protein  57.93 
 
 		 178 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.127657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4255  hypothetical protein  57.93 
 
 		 178 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30650  hypothetical protein  56.38 
 
 		 196 aa  155  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1437  hypothetical protein  59.59 
 
 		 224 aa  154  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2160  hypothetical protein  55.86 
 
 		 169 aa  147  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30420  hypothetical protein  49.34 
 
 		 199 aa  130  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.711369  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  38.93 
 
 		 186 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4534  protein of unknown function DUF1130  40.82 
 
 		 181 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360408  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  40.14 
 
 		 224 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4520  hypothetical protein  37.25 
 
 		 176 aa  94.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  35.33 
 
 		 178 aa  94.7  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  37.93 
 
 		 182 aa  90.9  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  35.62 
 
 		 178 aa  89.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0793  hypothetical protein  36.67 
 
 		 198 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1153  protein of unknown function DUF1130  41.22 
 
 		 195 aa  88.2  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.908122 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  39.6 
 
 		 177 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  37.16 
 
 		 185 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  34 
 
 		 177 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0017  hypothetical protein  45.21 
 
 		 177 aa  83.6  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3417  hypothetical protein  35.33 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  34.93 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  34.69 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  36.49 
 
 		 191 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  36.49 
 
 		 191 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4854  hypothetical protein  34.67 
 
 		 192 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.0401842 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4337  hypothetical protein  34.67 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0844376  hitchhiker  0.00670192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3526  hypothetical protein  38.41 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4695  protein of unknown function DUF1130  37.84 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0878626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4905  hypothetical protein  34.44 
 
 		 194 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.556359  normal  0.961888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3461  hypothetical protein  34.44 
 
 		 194 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5381  hypothetical protein  34.44 
 
 		 194 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782244  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3471  hypothetical protein  39.33 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.646682  normal  0.0531544 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0015  hypothetical protein  40.27 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0033  protein of unknown function DUF1130  40.94 
 
 		 183 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  35.61 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3408  hypothetical protein  37.09 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3555  protein of unknown function DUF1130  38.57 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3491  protein of unknown function DUF1130  38.57 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0317  hypothetical protein  42.19 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000191328  decreased coverage  0.00259322 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  32.62 
 
 		 351 aa  52  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1081  hypothetical protein  27.69 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3108  hypothetical protein  37.88 
 
 		 106 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0971254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0626  protein of unknown function DUF1130  21.05 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  32.54 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1460  hypothetical protein  31.75 
 
 		 173 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  28.67 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0743  hypothetical protein  30.22 
 
 		 319 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  25.37 
 
 		 199 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000271396  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2775  hypothetical protein  28.7 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2774  hypothetical protein  28.19 
 
 		 209 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670042  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  31.82 
 
 		 195 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  30.95 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  31.45 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>