211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1627 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 		 300 aa  600  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  50.49 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  47.91 
 
 		 311 aa  277  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  44.55 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  39.2 
 
 		 326 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  37.22 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  37.22 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  38.29 
 
 		 317 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  36.39 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  36.39 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  36.39 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  36.91 
 
 		 317 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  36.91 
 
 		 317 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  36.08 
 
 		 317 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  36.91 
 
 		 317 aa  202  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  36.08 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  36.08 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  36.08 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  36.08 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1563  flagellar hook-associated protein 3  39.74 
 
 		 309 aa  198  7.999999999999999e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  37.03 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  35.28 
 
 		 326 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  35.28 
 
 		 326 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  35.33 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  47.54 
 
 		 412 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  35.26 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  36.51 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1878  flagellar hook-associated protein FlgL  35.31 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  46.74 
 
 		 404 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  47.03 
 
 		 401 aa  172  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4781  flagellar hook-associated protein 3  32.39 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.892762  normal  0.741415 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3704  flagellar hook-associated protein 3  32.39 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.218733  normal  0.125395 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  41.36 
 
 		 410 aa  159  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  44.57 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  30.46 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  42.08 
 
 		 411 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  42.08 
 
 		 411 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  43.01 
 
 		 439 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  41.53 
 
 		 411 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  41.62 
 
 		 406 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  41.71 
 
 		 410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  30.16 
 
 		 305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  37.84 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  34.31 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  41.3 
 
 		 562 aa  142  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  42.08 
 
 		 400 aa  142  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  37.5 
 
 		 532 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  37.95 
 
 		 433 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  33.78 
 
 		 248 aa  138  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  39.89 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  40.44 
 
 		 408 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  38.25 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  31.01 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  36.61 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  37.16 
 
 		 407 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  36.07 
 
 		 407 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  35.11 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  35.52 
 
 		 410 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  35.52 
 
 		 410 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  35.52 
 
 		 410 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  35.52 
 
 		 410 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  35.52 
 
 		 410 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  35.52 
 
 		 410 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  35.52 
 
 		 410 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  28.52 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  37.16 
 
 		 413 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  27.83 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  37.16 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  34.26 
 
 		 521 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  37.16 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  28.24 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  30.51 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  33.83 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  39.26 
 
 		 401 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  29.64 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  40.76 
 
 		 523 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3941  flagellar hook-associated protein FlgL  35.65 
 
 		 520 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  40.49 
 
 		 396 aa  119  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3961  flagellar hook-associated protein 3  26.3 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  36.48 
 
 		 530 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  29.47 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  36.41 
 
 		 400 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  27.1 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  34.43 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  25.9 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  37.5 
 
 		 524 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  27.62 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  38.65 
 
 		 396 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  27.1 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  37.58 
 
 		 403 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  34.59 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  37.5 
 
 		 521 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  34.05 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  34.59 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  34.59 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  34.59 
 
 		 403 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  35.52 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  28.53 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  28.85 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>