More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0263 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  53.62 
 
 		 636 aa  665    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 630 aa  1277    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  57.03 
 
 		 646 aa  682    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  54.65 
 
 		 645 aa  726    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  50.72 
 
 		 673 aa  628  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  51.05 
 
 		 703 aa  628  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  49.61 
 
 		 801 aa  611  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  48.9 
 
 		 766 aa  608  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  49.29 
 
 		 793 aa  611  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  49.29 
 
 		 801 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  49.14 
 
 		 801 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  47.81 
 
 		 611 aa  595  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  51.28 
 
 		 648 aa  597  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  52.21 
 
 		 681 aa  593  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  49.92 
 
 		 679 aa  592  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  50.08 
 
 		 691 aa  588  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  49.84 
 
 		 683 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  50.08 
 
 		 650 aa  585  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  47.36 
 
 		 630 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  47.95 
 
 		 803 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  47.95 
 
 		 809 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  47.95 
 
 		 802 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  47.87 
 
 		 802 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  47.57 
 
 		 800 aa  568  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  50.08 
 
 		 655 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  47.87 
 
 		 802 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  47.87 
 
 		 802 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  47.79 
 
 		 803 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  47.87 
 
 		 802 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  46.62 
 
 		 635 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  50 
 
 		 646 aa  559  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  47.63 
 
 		 760 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  47.32 
 
 		 775 aa  561  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  47.63 
 
 		 765 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  47.63 
 
 		 765 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  48.37 
 
 		 631 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  47.05 
 
 		 631 aa  558  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  47.32 
 
 		 756 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  45.98 
 
 		 635 aa  555  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0242  peptidoglycan glycosyltransferase  49.84 
 
 		 646 aa  556  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  48.05 
 
 		 631 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  47.23 
 
 		 629 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  47 
 
 		 761 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0357  penicillin-binding protein 2  48.86 
 
 		 681 aa  555  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  47.32 
 
 		 764 aa  555  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.66 
 
 		 640 aa  553  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  46.74 
 
 		 629 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  46.08 
 
 		 629 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  46.23 
 
 		 771 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  46.07 
 
 		 767 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  46.91 
 
 		 629 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.31 
 
 		 618 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  45.28 
 
 		 646 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  45.41 
 
 		 646 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  45.44 
 
 		 629 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  46.64 
 
 		 619 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  44.79 
 
 		 629 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  47.34 
 
 		 627 aa  525  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  44.79 
 
 		 630 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  40.45 
 
 		 628 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04259  penicillin-binding protein 2  45.69 
 
 		 686 aa  511  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.209813  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  41.42 
 
 		 638 aa  511  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  42.99 
 
 		 633 aa  511  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  41.56 
 
 		 618 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  42.26 
 
 		 637 aa  505  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  43.8 
 
 		 630 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  43.97 
 
 		 626 aa  500  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0590  penicillin-binding protein 2  44.84 
 
 		 687 aa  501  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  41.63 
 
 		 618 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  41.63 
 
 		 618 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  45.88 
 
 		 630 aa  501  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  42.81 
 
 		 618 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0671  peptidoglycan glycosyltransferase  44.84 
 
 		 687 aa  501  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.195303  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.45 
 
 		 641 aa  498  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  41.69 
 
 		 618 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  41.46 
 
 		 618 aa  498  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  41.69 
 
 		 618 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  41.69 
 
 		 618 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  40.44 
 
 		 638 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  40.56 
 
 		 610 aa  495  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  41.63 
 
 		 618 aa  498  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  41.69 
 
 		 618 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  41.07 
 
 		 634 aa  498  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  40.52 
 
 		 633 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  40.52 
 
 		 633 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  44.02 
 
 		 631 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  40.52 
 
 		 633 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  43.29 
 
 		 655 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  40.52 
 
 		 633 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  43.86 
 
 		 667 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  40.52 
 
 		 633 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3451  penicillin-binding protein 2  45.78 
 
 		 691 aa  495  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  40.36 
 
 		 633 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  40.52 
 
 		 633 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  41.37 
 
 		 643 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  40.52 
 
 		 633 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  41.63 
 
 		 618 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  40.52 
 
 		 633 aa  494  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  39.55 
 
 		 633 aa  491  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  43.88 
 
 		 632 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>