83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0035 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0035  CBS domain-containing protein  100 
 
 
201 aa  406  1e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0035  CBS domain-containing protein  98.51 
 
 
201 aa  400  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268631  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1465  CBS domain-containing protein  39.3 
 
 
202 aa  156  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.969653  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1304  signal-transduction protein  39.3 
 
 
200 aa  148  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  27.27 
 
 
219 aa  82.8  3e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1104  signal-transduction protein  28.43 
 
 
207 aa  82.4  4e-15  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  23.67 
 
 
224 aa  70.1  2e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  24.27 
 
 
223 aa  67.8  9e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  22.06 
 
 
223 aa  66.2  3e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  23.3 
 
 
256 aa  65.9  4e-10  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  24.2 
 
 
222 aa  62  6e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 
225 aa  60.1  2e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  25.13 
 
 
227 aa  59.7  3e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  24.34 
 
 
214 aa  58.9  5e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  26.53 
 
 
209 aa  57.4  1e-07  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  25.12 
 
 
211 aa  57.8  1e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  23.04 
 
 
211 aa  57.4  2e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  25 
 
 
220 aa  55.5  6e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  28.85 
 
 
208 aa  54.3  1e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  25.59 
 
 
215 aa  54.3  1e-06  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  31.68 
 
 
221 aa  53.5  2e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  6.50498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 
216 aa  53.5  2e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  25 
 
 
214 aa  53.1  3e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  21.84 
 
 
230 aa  52.8  4e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  25.12 
 
 
215 aa  52  6e-06  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  24.44 
 
 
214 aa  50.8  1e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  7.9186e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  22.27 
 
 
210 aa  50.1  2e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2558  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.14 
 
 
484 aa  50.4  2e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2261  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.25 
 
 
484 aa  49.7  3e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  21.63 
 
 
232 aa  49.7  3e-05  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  28.57 
 
 
128 aa  49.7  3e-05  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  35.06 
 
 
615 aa  49.3  4e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0657  CBS domain containing protein  21.16 
 
 
222 aa  48.9  5e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  20.39 
 
 
221 aa  48.5  6e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  22.33 
 
 
214 aa  48.1  7e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  22.33 
 
 
214 aa  48.1  7e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  22.33 
 
 
214 aa  48.5  7e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  22.33 
 
 
214 aa  48.1  7e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  22.33 
 
 
214 aa  48.1  8e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  24.42 
 
 
214 aa  48.1  8e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  22.33 
 
 
214 aa  48.1  8e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  22.33 
 
 
214 aa  48.1  8e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  22.33 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  24.54 
 
 
202 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  22.4 
 
 
143 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  21.84 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  21.84 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.17116e-06 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0982  CBS domain containing protein  19.19 
 
 
220 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.646716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  25.95 
 
 
149 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1283  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  28.81 
 
 
397 aa  45.4  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  32.94 
 
 
171 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  30.7 
 
 
446 aa  44.7  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  28.57 
 
 
340 aa  44.7  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  22.96 
 
 
154 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  29.73 
 
 
344 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  25.21 
 
 
290 aa  44.3  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  24.6 
 
 
389 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1350  CBS domain containing membrane protein  31.76 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  29.82 
 
 
446 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  26.83 
 
 
127 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  26.61 
 
 
230 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  25.19 
 
 
162 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 
141 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  22.66 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 
386 aa  43.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  27.01 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  22.95 
 
 
164 aa  42.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  28.21 
 
 
139 aa  42.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  26.05 
 
 
139 aa  42.4  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  23.93 
 
 
378 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1247  CBS domain-containing protein  23.39 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  31.62 
 
 
454 aa  42.7  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1039  putative signal transduction protein with CBS domains  27.59 
 
 
260 aa  42.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  27.13 
 
 
375 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  23.26 
 
 
131 aa  42.4  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  3.12526e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4201  KpsF/GutQ family protein  29.82 
 
 
333 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.899261  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3892  CBS domain containing protein  20.63 
 
 
223 aa  42  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2102  protein of unknown function DUF21  33.8 
 
 
468 aa  42  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.573488  normal  0.797611 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  26.56 
 
 
381 aa  41.6  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  24.78 
 
 
483 aa  41.6  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  25 
 
 
234 aa  41.6  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  23.08 
 
 
378 aa  41.2  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3240  magnesium transporter  30.89 
 
 
451 aa  41.2  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0666949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>