More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2803 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2803  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 		 149 aa  312  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2143  methionine sulfoxide reductase B  82.31 
 
 		 149 aa  260  4e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2441  methionine sulfoxide reductase B  79.59 
 
 		 148 aa  249  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.660981 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2966  methionine sulfoxide reductase B  78.91 
 
 		 148 aa  243  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3364  methionine sulfoxide reductase B  79.86 
 
 		 148 aa  240  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0446  methionine sulfoxide reductase B  77.78 
 
 		 146 aa  233  9e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.342631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0390  methionine sulfoxide reductase B  77.78 
 
 		 146 aa  233  9e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.504869  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3070  methionine sulfoxide reductase B  71.43 
 
 		 150 aa  228  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0125  methionine sulfoxide reductase B  71.72 
 
 		 147 aa  226  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5573  methionine sulfoxide reductase B  72.92 
 
 		 147 aa  224  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139871  normal  0.0985113 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5350  methionine sulfoxide reductase B  74.83 
 
 		 147 aa  223  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4326  methionine sulfoxide reductase B  70.07 
 
 		 148 aa  221  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  69.78 
 
 		 154 aa  208  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5179  methionine-R-sulfoxide reductase  68.84 
 
 		 153 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5091  protein-methionine-S-oxide reductase  68.84 
 
 		 153 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5470  methionine-R-sulfoxide reductase  68.12 
 
 		 153 aa  203  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  66.44 
 
 		 150 aa  202  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1106  methionine-R-sulfoxide reductase  68.84 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3736  protein-methionine-S-oxide reductase  65.96 
 
 		 151 aa  192  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  56.16 
 
 		 158 aa  178  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  58.5 
 
 		 364 aa  176  8e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1519  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  60.81 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1003  methionine sulfoxide reductase B  59.71 
 
 		 186 aa  174  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 375 aa  173  6e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  63.16 
 
 		 351 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2072  methionine sulfoxide reductase B  56.29 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0195  methionine sulfoxide reductase B  65.04 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000568952  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  59.23 
 
 		 735 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0188  methionine-R-sulfoxide reductase  56.93 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  62.41 
 
 		 155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  60 
 
 		 385 aa  169  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2286  methionine-R-sulfoxide reductase  60.45 
 
 		 153 aa  169  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  62.79 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  63.57 
 
 		 321 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  62.79 
 
 		 321 aa  169  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  63.57 
 
 		 321 aa  168  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  62.79 
 
 		 321 aa  167  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  62.79 
 
 		 321 aa  167  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  62.79 
 
 		 321 aa  167  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  62.79 
 
 		 321 aa  167  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  62.79 
 
 		 321 aa  167  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  59.4 
 
 		 348 aa  166  8e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1127  methionine sulfoxide reductase B  58.27 
 
 		 151 aa  166  9e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.103826  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  62.02 
 
 		 321 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  64.23 
 
 		 359 aa  166  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  62.02 
 
 		 321 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  57.46 
 
 		 368 aa  166  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  62.02 
 
 		 321 aa  166  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1860  methionine sulfoxide reductase B  59.23 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000145695  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1554  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  57.89 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  59.69 
 
 		 381 aa  164  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1577  methionine sulfoxide reductase B  58.91 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.14 
 
 		 311 aa  164  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  55.86 
 
 		 397 aa  164  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  57.04 
 
 		 316 aa  163  6.9999999999999995e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  58.02 
 
 		 380 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  53.85 
 
 		 352 aa  162  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  58.96 
 
 		 317 aa  162  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  58.91 
 
 		 380 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  61.11 
 
 		 405 aa  161  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  55.88 
 
 		 332 aa  160  4.0000000000000004e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  58.65 
 
 		 323 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  55.64 
 
 		 346 aa  159  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  55.3 
 
 		 590 aa  159  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  57.58 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  53.38 
 
 		 611 aa  159  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  58.02 
 
 		 394 aa  158  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  57.04 
 
 		 337 aa  157  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  59.54 
 
 		 290 aa  157  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  56.34 
 
 		 338 aa  157  4e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1503  methionine-R-sulfoxide reductase  54.68 
 
 		 144 aa  157  7e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000972578  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0910  methionine sulfoxide reductase B  61.6 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  55.22 
 
 		 416 aa  155  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  56.72 
 
 		 368 aa  155  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0999  methionine sulfoxide reductase B  55.81 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.680503  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  57.69 
 
 		 187 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  53.62 
 
 		 416 aa  155  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  55.86 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  53.47 
 
 		 202 aa  153  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1104  methionine sulfoxide reductase B  53.24 
 
 		 167 aa  153  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1104  methionine sulfoxide reductase B  53.24 
 
 		 167 aa  153  8e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  55.22 
 
 		 320 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  54.89 
 
 		 353 aa  150  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 212 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0704  methionine sulfoxide reductase B  59.38 
 
 		 191 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  51.85 
 
 		 181 aa  148  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  54.26 
 
 		 309 aa  148  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  56.15 
 
 		 328 aa  148  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.29 
 
 		 322 aa  148  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1483  methionine sulfoxide reductase B  49.63 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1512  methionine sulfoxide reductase B  49.63 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  53.79 
 
 		 329 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1778  methionine-R-sulfoxide reductase  54.92 
 
 		 206 aa  139  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1972  methionine-R-sulfoxide reductase  52.34 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2214  methionine-R-sulfoxide reductase  48.55 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.399657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  56.14 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  56.14 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  54.1 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  56.14 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  56.14 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>