More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2272 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 320 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  60.77 
 
 		 318 aa  348  9e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  54.69 
 
 		 311 aa  322  4e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  56.04 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  57.24 
 
 		 310 aa  315  8e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  56.38 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  55.56 
 
 		 308 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  57.38 
 
 		 314 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  53.69 
 
 		 314 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  55.37 
 
 		 307 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  55.03 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2627  methionyl-tRNA formyltransferase  61.49 
 
 		 314 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.640895  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  49.16 
 
 		 314 aa  299  4e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  52.68 
 
 		 310 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  54.36 
 
 		 307 aa  298  7e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  52.68 
 
 		 310 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  52.35 
 
 		 310 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  49.67 
 
 		 315 aa  295  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  48.82 
 
 		 314 aa  295  7e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  52.01 
 
 		 310 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  51.34 
 
 		 314 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  50.65 
 
 		 312 aa  295  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  49.83 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  49.83 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  52.35 
 
 		 319 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  53.69 
 
 		 307 aa  293  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  50.67 
 
 		 319 aa  292  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  57.38 
 
 		 325 aa  291  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  49.03 
 
 		 315 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  49.66 
 
 		 315 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  49.66 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  49.66 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  49.66 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  49.66 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  49.33 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  49.66 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  49.03 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  52.15 
 
 		 323 aa  288  8e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  48.67 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  53.69 
 
 		 314 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  53.29 
 
 		 311 aa  285  8e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  52.36 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  47.47 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  45.43 
 
 		 329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  48.06 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  48.06 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  49.49 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  48.06 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  48.06 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  48 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  48.06 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  47.65 
 
 		 320 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  47.33 
 
 		 315 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  50.67 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  49 
 
 		 321 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  47.99 
 
 		 313 aa  281  9e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  49.66 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  49.66 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  49.66 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  49.16 
 
 		 318 aa  279  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  50.51 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  49.16 
 
 		 318 aa  279  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  46.36 
 
 		 316 aa  276  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  48.82 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  49.5 
 
 		 315 aa  275  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  45.31 
 
 		 321 aa  275  8e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  48.48 
 
 		 318 aa  275  9e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  53.64 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  48.99 
 
 		 315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  48.48 
 
 		 318 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  48.99 
 
 		 315 aa  272  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  47.02 
 
 		 322 aa  271  9e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  47.65 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  48.48 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  48.82 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  48.48 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  51.37 
 
 		 307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  48.15 
 
 		 318 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  50.78 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  46.73 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  46.41 
 
 		 318 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  53.77 
 
 		 344 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  45.45 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  47.54 
 
 		 317 aa  262  4.999999999999999e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 		 327 aa  262  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  53.36 
 
 		 313 aa  261  8e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0021  methionyl-tRNA formyltransferase  53.36 
 
 		 313 aa  261  8e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.223082 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  47.37 
 
 		 302 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  47.57 
 
 		 301 aa  259  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  43.58 
 
 		 318 aa  258  9e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  53.16 
 
 		 331 aa  258  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  44.06 
 
 		 332 aa  258  9e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  44.48 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  50.16 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  43.9 
 
 		 348 aa  256  3e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  44.22 
 
 		 326 aa  255  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  44.92 
 
 		 311 aa  255  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  49.49 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  47.8 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>