41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13554 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  676    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  76.18 
 
 
338 aa  524  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  75.59 
 
 
338 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  75.59 
 
 
338 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  76.05 
 
 
332 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  76.05 
 
 
330 aa  508  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  58.57 
 
 
320 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3964  protein of unknown function DUF35  59.27 
 
 
329 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  56.78 
 
 
319 aa  371  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2642  hypothetical protein  56.39 
 
 
329 aa  354  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13056  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2839  hypothetical protein  55.63 
 
 
319 aa  341  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11529  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  46.62 
 
 
335 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3983  protein of unknown function DUF35  46.33 
 
 
309 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.411104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1482  nucleic-acid-binding protein containing a Zn- ribbon-like protein  46 
 
 
295 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  30.19 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  29.71 
 
 
165 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  37.04 
 
 
135 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  34.34 
 
 
134 aa  53.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  30.43 
 
 
142 aa  53.1  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2762  hypothetical protein  30.83 
 
 
158 aa  52.8  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.10983  normal  0.416635 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  24.07 
 
 
178 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  30.28 
 
 
128 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3784  protein of unknown function DUF35  27.03 
 
 
165 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0099748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  26.72 
 
 
130 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  34.82 
 
 
123 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  33.67 
 
 
129 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  29.25 
 
 
151 aa  47  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  35.05 
 
 
131 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  32.71 
 
 
121 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  30.39 
 
 
135 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  30.14 
 
 
177 aa  46.2  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0984  hypothetical protein  34.02 
 
 
132 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  35.29 
 
 
141 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  30.58 
 
 
148 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  25.68 
 
 
128 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  28.36 
 
 
141 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  32.43 
 
 
139 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  26.61 
 
 
123 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  30.84 
 
 
138 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  29.57 
 
 
132 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  32.32 
 
 
134 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>