More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1452 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 478 aa  952    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  63.73 
 
 		 520 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  63.19 
 
 		 514 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  63.19 
 
 		 514 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  60.99 
 
 		 507 aa  592  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  58.12 
 
 		 518 aa  571  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  57.14 
 
 		 517 aa  562  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  56.99 
 
 		 461 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0309  DNA repair protein RadA  60.8 
 
 		 465 aa  527  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.503927  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2383  DNA repair protein RadA  61.25 
 
 		 465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  54.45 
 
 		 459 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  54.66 
 
 		 459 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26521  DNA repair protein RadA  60.5 
 
 		 464 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  53.36 
 
 		 484 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  49.58 
 
 		 458 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  49.68 
 
 		 458 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  49.26 
 
 		 458 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  49.26 
 
 		 458 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  49.05 
 
 		 457 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  49.26 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  49.26 
 
 		 458 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  49.58 
 
 		 458 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  49.26 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  49.37 
 
 		 458 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  49.26 
 
 		 458 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  48.53 
 
 		 457 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  49.26 
 
 		 458 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  51.17 
 
 		 448 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  51.48 
 
 		 453 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0135  DNA repair protein RadA  45.88 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01501  DNA repair protein RadA  45.57 
 
 		 450 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  49.11 
 
 		 454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01521  DNA repair protein RadA  45.55 
 
 		 450 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.268386  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  46.47 
 
 		 454 aa  442  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  46.24 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  48.09 
 
 		 489 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  49.79 
 
 		 476 aa  443  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01611  DNA repair protein RadA  45.15 
 
 		 450 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.821199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  48.1 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  49.25 
 
 		 449 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  49.66 
 
 		 449 aa  438  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  47.19 
 
 		 470 aa  436  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  49.06 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  45.26 
 
 		 454 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  45.26 
 
 		 454 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  47.85 
 
 		 450 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  48.71 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  48.72 
 
 		 448 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  48.53 
 
 		 453 aa  430  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  45.76 
 
 		 457 aa  428  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  44.21 
 
 		 459 aa  428  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  49.1 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  46.67 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  51.38 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  48.08 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  46.62 
 
 		 452 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  48.42 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  47.63 
 
 		 455 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  50.64 
 
 		 456 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  44.94 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  46.3 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  50.21 
 
 		 456 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  44.61 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  51.49 
 
 		 408 aa  412  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  46.27 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  50.91 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  48.82 
 
 		 455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  46.06 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  48.83 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  48.71 
 
 		 458 aa  405  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2252  DNA repair protein RadA  48.34 
 
 		 472 aa  405  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  45.55 
 
 		 462 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  45.26 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  45.86 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  49.66 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  47.33 
 
 		 452 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  49.66 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1239  DNA repair protein RadA  49.04 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.873439 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2457  DNA repair protein RadA  49.66 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  47.33 
 
 		 452 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  49.66 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  48.93 
 
 		 458 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  49.66 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  48.28 
 
 		 458 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2077  DNA repair protein RadA  49.66 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0646051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  47.42 
 
 		 451 aa  405  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  47.37 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2513  DNA repair protein RadA  49.66 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167746  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  45.34 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  47.97 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  46.02 
 
 		 452 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0965  DNA repair protein RadA  49.36 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2602  DNA repair protein RadA  49.44 
 
 		 458 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0200982  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5347  DNA repair protein RadA  48.71 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  49.55 
 
 		 466 aa  401  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  48.76 
 
 		 467 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6039  DNA repair protein RadA  48.5 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667951  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2038  DNA repair protein RadA  48.71 
 
 		 458 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1179  DNA repair protein RadA  45.89 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.595072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>