More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1308 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 355 aa  737    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.01 
 
 		 337 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.61 
 
 		 336 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  76.58 
 
 		 339 aa  546  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  75.3 
 
 		 335 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  75.3 
 
 		 336 aa  524  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  75.3 
 
 		 336 aa  524  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.21 
 
 		 337 aa  509  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.51 
 
 		 335 aa  503  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.97 
 
 		 337 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.46 
 
 		 337 aa  481  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.26 
 
 		 337 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.47 
 
 		 337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.54 
 
 		 338 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.54 
 
 		 338 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.84 
 
 		 338 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  62.69 
 
 		 342 aa  427  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 		 347 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  57.46 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 336 aa  364  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 328 aa  361  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 348 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 339 aa  344  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 339 aa  342  5e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 334 aa  340  2e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 336 aa  339  5e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 		 335 aa  335  7.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 328 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 350 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 327 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 336 aa  329  4e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 350 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 334 aa  328  6e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 329 aa  328  8e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 329 aa  328  8e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 329 aa  328  8e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 		 329 aa  328  8e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 329 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 329 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 329 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 329 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 355 aa  325  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 332 aa  325  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.86 
 
 		 348 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 327 aa  325  6e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 329 aa  324  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.86 
 
 		 347 aa  324  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 346 aa  323  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.86 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 346 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 344 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 346 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 338 aa  323  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 328 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 355 aa  323  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00502  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 		 335 aa  322  5e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 354 aa  322  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 332 aa  322  8e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 341 aa  322  9.000000000000001e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 		 338 aa  322  9.000000000000001e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.58 
 
 		 353 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0480  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 335 aa  321  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288652  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.86 
 
 		 350 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 334 aa  320  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 334 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 332 aa  319  5e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 334 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1212  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 		 344 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 334 aa  319  5e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 332 aa  319  5e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 334 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 334 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1229  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 		 344 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 334 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 332 aa  318  7e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 334 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 334 aa  318  9e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 334 aa  318  9e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  49.1 
 
 		 334 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 334 aa  318  9e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 		 353 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 334 aa  318  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 337 aa  317  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 		 353 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 334 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 334 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 342 aa  317  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 334 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1239  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 344 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.244694 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00082  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 345 aa  316  3e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>