More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0427 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  100 
 
 
282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  65.44 
 
 
300 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  55.47 
 
 
279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  50.73 
 
 
279 aa  279  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0529  ABC transporter related  52.88 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0717858  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  50.36 
 
 
309 aa  268  5.9999999999999995e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.81 
 
 
328 aa  259  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  49.35 
 
 
327 aa  254  9e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.26 
 
 
339 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  49.79 
 
 
329 aa  251  6e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.62 
 
 
328 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  45.09 
 
 
279 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  52 
 
 
330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.66 
 
 
328 aa  243  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 
266 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.94 
 
 
323 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.87 
 
 
324 aa  236  3e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.39 
 
 
326 aa  236  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.8 
 
 
324 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.52 
 
 
325 aa  233  3e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  43.75 
 
 
302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.69 
 
 
333 aa  230  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.4 
 
 
322 aa  228  7e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1827  ABC transporter related  41.67 
 
 
279 aa  228  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.215935  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.46 
 
 
323 aa  228  8e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.58 
 
 
323 aa  228  8e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  40.74 
 
 
312 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.72 
 
 
326 aa  227  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  41.58 
 
 
293 aa  226  3e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 
345 aa  226  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  40.07 
 
 
310 aa  225  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  48 
 
 
330 aa  224  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  42.33 
 
 
313 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0614  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.62 
 
 
374 aa  223  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.668059 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  51.79 
 
 
316 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.93 
 
 
327 aa  223  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.44 
 
 
312 aa  223  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.93 
 
 
327 aa  223  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.91 
 
 
324 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.47 
 
 
334 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  41.78 
 
 
339 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  42.18 
 
 
310 aa  221  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  40.33 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  41.8 
 
 
314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  40.97 
 
 
330 aa  220  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  37.07 
 
 
305 aa  220  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.59 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  41.16 
 
 
310 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.73 
 
 
325 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.49 
 
 
334 aa  218  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  38.11 
 
 
320 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  40.4 
 
 
326 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  46.58 
 
 
319 aa  216  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  40.88 
 
 
311 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  48.61 
 
 
260 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.95 
 
 
338 aa  217  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  39.26 
 
 
305 aa  217  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1263  ABC transporter related  41.43 
 
 
279 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.600052  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  41.97 
 
 
355 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  40.86 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  40.8 
 
 
309 aa  216  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.16 
 
 
321 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
319 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.61 
 
 
343 aa  216  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  37.87 
 
 
303 aa  215  8e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  41.47 
 
 
304 aa  214  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.27 
 
 
333 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.78 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.8 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  42.62 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.89 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.13 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  43.7 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  40.86 
 
 
311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.26 
 
 
317 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.69 
 
 
316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  40.14 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.02 
 
 
308 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.34 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  41.58 
 
 
345 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  39.74 
 
 
303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  46.33 
 
 
257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 
312 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  41.02 
 
 
327 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  38.72 
 
 
316 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  38.34 
 
 
328 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  35.28 
 
 
312 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 
312 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2251  ABC transporter related protein  48.91 
 
 
266 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00759154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.43 
 
 
321 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 
312 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  35.28 
 
 
312 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.46 
 
 
338 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 
312 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.13 
 
 
316 aa  210  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 
312 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  40 
 
 
320 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 
312 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  43.5 
 
 
510 aa  209  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.53 
 
 
317 aa  209  4e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>