More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1744 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  100 
 
 		 352 aa  701    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  80.86 
 
 		 351 aa  525  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  69.12 
 
 		 359 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  57.49 
 
 		 351 aa  414  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  57.49 
 
 		 351 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  57.49 
 
 		 351 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  57.49 
 
 		 351 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  60.78 
 
 		 352 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  53.8 
 
 		 346 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  53.8 
 
 		 346 aa  362  4e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  42.77 
 
 		 355 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  43.08 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  42.72 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  41.59 
 
 		 356 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  41.27 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  41.36 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  45.14 
 
 		 341 aa  208  9e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  32.92 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  35.11 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  34.11 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  32.93 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  35.8 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  33.12 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  33.93 
 
 		 332 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  34.1 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  34.04 
 
 		 346 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  35.76 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  30.98 
 
 		 332 aa  180  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  31.99 
 
 		 332 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  32 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  34.29 
 
 		 333 aa  178  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  31.51 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  34.98 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  30.26 
 
 		 325 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  27.69 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  30.72 
 
 		 330 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  34.97 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  34.07 
 
 		 384 aa  166  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  29.97 
 
 		 335 aa  166  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  33.44 
 
 		 509 aa  166  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  30.53 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  30.37 
 
 		 339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  30.53 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  38.84 
 
 		 345 aa  159  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  30.23 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  30.23 
 
 		 334 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  33.96 
 
 		 331 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  30 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  30 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  32.08 
 
 		 371 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  32.51 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  27.58 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  28.66 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  29.94 
 
 		 337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  31.56 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  27.36 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  32.23 
 
 		 352 aa  152  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  30 
 
 		 355 aa  149  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  32.68 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  28.09 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  26.77 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  27.44 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  28.96 
 
 		 357 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  27.13 
 
 		 335 aa  116  6.9999999999999995e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  28.62 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  23.99 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  34.47 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  33.66 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  33.62 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  23.26 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  29.87 
 
 		 366 aa  109  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  24.6 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  25.23 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  32.35 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  25.68 
 
 		 347 aa  102  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  21.99 
 
 		 531 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  25.15 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  30.08 
 
 		 256 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  23.93 
 
 		 376 aa  99.8  7e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  27.31 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  29.32 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  25.75 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  30.05 
 
 		 393 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  26.62 
 
 		 355 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  25.32 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  25.32 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  25.32 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  25.32 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  25.32 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  25.32 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  25.32 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  25.32 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  27.46 
 
 		 341 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0848  TrkA-N  29.02 
 
 		 347 aa  93.2  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0423628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  32.22 
 
 		 182 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  27.49 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  29.41 
 
 		 355 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  27.36 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  31.67 
 
 		 684 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>