83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0622 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0622  biotin biosynthesis protein BioC  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2050  biotin biosynthesis  55.51 
 
 		 254 aa  274  8e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.146243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04571  methylase  48.37 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18701  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  43.95 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15901  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  45.53 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1001  SAM dependent methyltransferase  43.55 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16501  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.47 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.286767  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1563  biotin synthesis protein BioC, putative  31.76 
 
 		 256 aa  154  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16601  methylase  29.96 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.203041  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.55 
 
 		 252 aa  138  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0029  hypothetical protein  33.62 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  23.05 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  29.13 
 
 		 474 aa  62.4  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  29.89 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.51 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  26.98 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  36 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  29.75 
 
 		 267 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  30.13 
 
 		 269 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  26.46 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  27.33 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.81 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.51 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.67 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.63 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  27.59 
 
 		 253 aa  48.9  0.00009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  23.53 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  28.3 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.29 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.68 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  28.75 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  24.89 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  24.89 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.19 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  32.77 
 
 		 177 aa  47  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  29.84 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  35 
 
 		 285 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  21.96 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  26.25 
 
 		 325 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  20.51 
 
 		 329 aa  45.8  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  31.4 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  22.03 
 
 		 281 aa  45.8  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  30.16 
 
 		 307 aa  46.2  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  32.14 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  29.91 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  22.03 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  30.84 
 
 		 309 aa  45.4  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.29 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  25.31 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  20.89 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.71 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.51 
 
 		 305 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  36.54 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  0.000000322294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  25.31 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2774  biotin biosynthesis protein BioC  29.41 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0014139  hitchhiker  0.00911196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.92 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.29 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  25.17 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.17 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 210 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  25.64 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  21.23 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  22.64 
 
 		 291 aa  42.7  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  33 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1043  biotin synthesis protein  21.23 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.59 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 348 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0386  trans-aconitate 2-methyltransferase  33 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.7 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  33 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  29.85 
 
 		 274 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2399  Methyltransferase type 11  25.87 
 
 		 210 aa  42.7  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.521103  normal  0.920683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  29.85 
 
 		 274 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  28.26 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  36.46 
 
 		 258 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>