33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0059 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0059  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  431  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0063  hypothetical protein  70.95 
 
 
212 aa  312  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00651  hypothetical protein  57.78 
 
 
226 aa  241  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2528  hypothetical protein  58.25 
 
 
228 aa  143  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2236  NC domain protein  47.01 
 
 
226 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404744 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4214  hypothetical protein  35.22 
 
 
228 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3825  hypothetical protein  43.36 
 
 
225 aa  98.2  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3774  hypothetical protein  43.36 
 
 
225 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1231  hypothetical protein  44.19 
 
 
154 aa  95.1  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00832087  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4647  NC domain-containing protein  45.28 
 
 
149 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1046  NC domain-containing protein  31.55 
 
 
240 aa  88.6  7e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0134514  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5550  hypothetical protein  47.79 
 
 
159 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.927914  normal  0.571004 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6171  hypothetical protein  44.55 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.862503  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.13 
 
 
699 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3830  hypothetical protein  43.75 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.738224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4375  hypothetical protein  39.09 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  hitchhiker  0.0000000327117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0479  hypothetical protein  42.86 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4515  putative cell wall-associated hydrolase  39.67 
 
 
166 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104706  normal  0.503963 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4383  hypothetical protein  39.67 
 
 
166 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1819  hypothetical protein  44.14 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.81 
 
 
702 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4006  hypothetical protein  43.36 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.848587  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5872  hypothetical protein  43.52 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2422  hypothetical protein  41.18 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4313  NC domain-containing protein  36.36 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00671  hypothetical protein  56.52 
 
 
51 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.273629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1253  retinol acyltransferase domain-containing protein  33.71 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1770  retinol acyltransferase domain-containing protein  35 
 
 
240 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3516  retinol acyltransferase domain-containing protein  35 
 
 
240 aa  52  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1447  retinol acyltransferase domain-containing protein  35 
 
 
240 aa  51.6  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1693  retinol acyltransferase domain-containing protein  33 
 
 
240 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.36742  normal  0.0247076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1798  retinol acyltransferase domain-containing protein  33 
 
 
240 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.540939 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1526  hypothetical protein  31.58 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>