216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0657 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0657  cytidine deaminase  100 
 
 
128 aa  263  5.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.589099 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1838  cytidine deaminase  58.82 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  48.04 
 
 
138 aa  104  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  47.62 
 
 
136 aa  103  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  50.98 
 
 
132 aa  103  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  50 
 
 
131 aa  103  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  45.87 
 
 
127 aa  103  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  53 
 
 
129 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  47.66 
 
 
130 aa  100  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  46 
 
 
133 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  51.02 
 
 
127 aa  99  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  45.71 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  51.02 
 
 
129 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  51.02 
 
 
129 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  51.02 
 
 
129 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  52 
 
 
129 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  48.45 
 
 
138 aa  97.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  44.64 
 
 
132 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0413  cytidine deaminase  58.54 
 
 
130 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  51.52 
 
 
134 aa  96.7  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  44.64 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  44.64 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  44.64 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  44.64 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  44.64 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  45.87 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  44.64 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  44.64 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  42.73 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  41.73 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  49 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  48.39 
 
 
134 aa  94.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  46.67 
 
 
129 aa  94.7  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  48.39 
 
 
134 aa  94.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  43.69 
 
 
132 aa  94  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2661  hypothetical protein  57.32 
 
 
231 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  43.75 
 
 
132 aa  94  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  49 
 
 
135 aa  93.6  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0115  cytidine deaminase  57.32 
 
 
130 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1065  cytidine deaminase  57.32 
 
 
130 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1279  cytidine deaminase  57.32 
 
 
130 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2803  cytidine deaminase  57.32 
 
 
130 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.33392  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0139  cytidine deaminase  57.32 
 
 
130 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  46.3 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  46.6 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  48.39 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  47.96 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  46.88 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  45.1 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1393  cytidine deaminase  46.9 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.245306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  53.12 
 
 
135 aa  90.9  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0145  cytidine deaminase  47.96 
 
 
145 aa  90.5  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  45.83 
 
 
128 aa  90.1  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  43 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  43 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  43 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  43 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  43 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  43 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  43 
 
 
131 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  43 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  42 
 
 
131 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6661  cytidine deaminase  51.22 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872827  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  46.46 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  45.45 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  42 
 
 
131 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  45.92 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2761  cytidine deaminase  53.68 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  53.49 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  46.81 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  45.19 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  40.17 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  45.92 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  45.36 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  44.57 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  39.47 
 
 
129 aa  84.7  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  47.42 
 
 
135 aa  84  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  47 
 
 
151 aa  84  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4190  cytidine deaminase  47.42 
 
 
138 aa  84  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  41.28 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0811  cytidine deaminase  44.55 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.83 
 
 
582 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  41.38 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  40 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0755  cytidine deaminase  49.41 
 
 
234 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1024  cytidine deaminase  40.54 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  51.69 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5935  cytidine deaminase  45 
 
 
199 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0116924 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  41.75 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  41.18 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  40.65 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  45 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13346  cytidine deaminase  46.74 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.19995 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  44.9 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04930  cytidine deaminase  45.35 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  42.31 
 
 
388 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  39.39 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  39.05 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1469  cytidine deaminase  44.79 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0427929  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1316  cytidine deaminase  43.52 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.501646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>