More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2535 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  100 
 
 		 148 aa  280  6.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  50.68 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  45.95 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  48.95 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  50.33 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  48.28 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  47.59 
 
 		 147 aa  133  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  46.9 
 
 		 148 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  48.65 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  50.68 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  48.3 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  44.52 
 
 		 149 aa  127  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 		 148 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  43.24 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  46.94 
 
 		 147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  44.76 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  48.65 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  44.59 
 
 		 151 aa  124  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  46.26 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  44.59 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  40.56 
 
 		 151 aa  123  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  45.45 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  43.45 
 
 		 148 aa  120  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  47.97 
 
 		 149 aa  120  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  40.27 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  41.38 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  51.7 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  38.46 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  45.95 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  40.82 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  37.32 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 151 aa  113  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 148 aa  113  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 174 aa  112  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  38.41 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2135  ribosomal protein L9  45.86 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  40.44 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  47.3 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  44.59 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1975  50S ribosomal protein L9  44.3 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  35.66 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 151 aa  110  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 194 aa  110  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 178 aa  109  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 179 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0012  50S ribosomal protein L9  45.75 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181348  hitchhiker  0.0000209307 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1220  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.592412  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1529  50S ribosomal protein L9P  44.44 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00288476  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  35.17 
 
 		 191 aa  107  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 193 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 151 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 153 aa  106  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 148 aa  105  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 148 aa  105  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 148 aa  105  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>