More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2176 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2176  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  816    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01831  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 436 aa  272  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00289243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1841  histidine kinase  38.06 
 
 		 430 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.033812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  36.27 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03600  histidine kinase  36.16 
 
 		 432 aa  199  6e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0707295 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0527  histidine kinase  31.47 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0372  histidine kinase  38.77 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  30.57 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  35.9 
 
 		 429 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  31.6 
 
 		 416 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  31.6 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  31.6 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  29.62 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 475 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 457 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  29.37 
 
 		 416 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1235  histidine kinase  33.82 
 
 		 434 aa  169  9e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.14404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  29.37 
 
 		 416 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  35.9 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  28.88 
 
 		 416 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1791  sensor histidine kinase  29.85 
 
 		 395 aa  166  5e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 475 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  29.82 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  33.89 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  33.89 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  35.63 
 
 		 443 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 489 aa  157  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5304  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 444 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3933  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 422 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2302  histidine kinase  34.39 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110141  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  29.07 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 581 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0711  Signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.890851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 607 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  31.06 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1969  histidine kinase  34.02 
 
 		 463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 438 aa  146  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 454 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  35.22 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 621 aa  145  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 436 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 600 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 469 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  31.82 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  31.23 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 		 415 aa  140  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000404489  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3159  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 475 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1532  histidine kinase  35.34 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.628543  normal  0.374808 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  31.44 
 
 		 436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 513 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10540  histidine kinase  32.55 
 
 		 511 aa  140  4.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  36.36 
 
 		 481 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  35.43 
 
 		 599 aa  139  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  37.02 
 
 		 477 aa  139  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  37.45 
 
 		 477 aa  139  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 608 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  34.5 
 
 		 613 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 611 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 609 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 590 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 587 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 592 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 456 aa  137  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 524 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  36.09 
 
 		 469 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  32.78 
 
 		 587 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2530  histidine kinase  32.13 
 
 		 439 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0737  histidine kinase  34.67 
 
 		 455 aa  136  7.000000000000001e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00375027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  32.13 
 
 		 443 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  32.78 
 
 		 587 aa  136  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  33.33 
 
 		 565 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  31.78 
 
 		 496 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1327  sensor histidine kinase  28.4 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0088456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  34.7 
 
 		 613 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 587 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  33.61 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  34.7 
 
 		 613 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 500 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0505  Signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  36.84 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  36.6 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  34.25 
 
 		 613 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 639 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  34.25 
 
 		 613 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 444 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 504 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>