More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2137 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  100 
 
 
343 aa  707    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  42.21 
 
 
828 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  40.44 
 
 
841 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  39.39 
 
 
820 aa  276  5e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  40.4 
 
 
836 aa  275  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  41.08 
 
 
818 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  41.09 
 
 
835 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  40.11 
 
 
835 aa  273  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  43.53 
 
 
346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  40.61 
 
 
840 aa  272  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  39.83 
 
 
836 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  39.29 
 
 
835 aa  269  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  39.55 
 
 
842 aa  267  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  44.44 
 
 
389 aa  267  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.11 
 
 
842 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  40.5 
 
 
842 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  42.06 
 
 
836 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  39.83 
 
 
843 aa  263  4e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  40.79 
 
 
818 aa  262  6e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  42.57 
 
 
381 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  40.46 
 
 
828 aa  262  6.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  43.53 
 
 
329 aa  261  8.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  42.3 
 
 
388 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  39.27 
 
 
836 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  39.71 
 
 
843 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  39.38 
 
 
830 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  40.22 
 
 
833 aa  260  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  39.71 
 
 
828 aa  259  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  41.81 
 
 
392 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  42.4 
 
 
392 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  42.4 
 
 
392 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  41.46 
 
 
821 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  39.88 
 
 
827 aa  256  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  42.11 
 
 
392 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  38.83 
 
 
832 aa  255  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  42.36 
 
 
392 aa  255  7e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  41.31 
 
 
388 aa  255  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  42.11 
 
 
392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  39.43 
 
 
842 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  38.55 
 
 
832 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  42.11 
 
 
392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  42.11 
 
 
392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  41.31 
 
 
389 aa  252  6e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  42.11 
 
 
392 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  41.31 
 
 
388 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  41.31 
 
 
388 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  40.74 
 
 
389 aa  250  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.86 
 
 
837 aa  250  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  37.43 
 
 
830 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0327  putative nucleotidyl transferase  39.42 
 
 
381 aa  250  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  41.81 
 
 
392 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  38.64 
 
 
841 aa  248  9e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  36.97 
 
 
832 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  39.38 
 
 
784 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  39.38 
 
 
784 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  38.69 
 
 
712 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  38.71 
 
 
827 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  40.8 
 
 
784 aa  245  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  38.2 
 
 
833 aa  245  8e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  38.27 
 
 
816 aa  245  8e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  40.18 
 
 
784 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  40.18 
 
 
784 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  37.95 
 
 
835 aa  241  9e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  39.88 
 
 
784 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  39.88 
 
 
784 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  39.88 
 
 
784 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  39.88 
 
 
784 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  39.88 
 
 
784 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  36.03 
 
 
810 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  35.29 
 
 
776 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  36.36 
 
 
834 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.89 
 
 
828 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  37.2 
 
 
361 aa  233  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  39.43 
 
 
820 aa  233  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  36.47 
 
 
370 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  37.2 
 
 
361 aa  233  5e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  37.2 
 
 
361 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  35.61 
 
 
370 aa  229  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  34.76 
 
 
785 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  36.68 
 
 
370 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 
854 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0300  nucleotidyl transferase  36.84 
 
 
397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  34.37 
 
 
348 aa  220  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  37.76 
 
 
347 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  35.33 
 
 
347 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0712  nucleotidyl transferase  36.81 
 
 
376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  34.96 
 
 
399 aa  209  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  34.96 
 
 
392 aa  206  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
349 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  34.64 
 
 
392 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  33.81 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  33.71 
 
 
387 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  34.25 
 
 
366 aa  195  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  34 
 
 
387 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  33.9 
 
 
392 aa  193  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 
387 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0827  nucleotidyl transferase  30.65 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  32.44 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  29.67 
 
 
365 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3313  nucleotidyl transferase  41.67 
 
 
262 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.618887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>