46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1804 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  100 
 
 		 162 aa  336  8e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  75.93 
 
 		 162 aa  265  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  53.42 
 
 		 161 aa  168  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  49.08 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  44.62 
 
 		 127 aa  104  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  37.58 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  40.61 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.2 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  36.14 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.94 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  37.8 
 
 		 199 aa  95.9  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  36.97 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  34.13 
 
 		 165 aa  95.1  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.13 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.98 
 
 		 173 aa  94  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  34.36 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  38.79 
 
 		 169 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  35.76 
 
 		 185 aa  90.9  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  33.94 
 
 		 165 aa  90.5  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  35.37 
 
 		 165 aa  90.9  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  31.93 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.74 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  33.13 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  33.94 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.37 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  32.18 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  33.13 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  32.93 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.93 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.33 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  30.3 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.93 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.55 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  29.7 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  27.61 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.94 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.53 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  31.1 
 
 		 189 aa  70.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.48 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  34.13 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.31 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  27.61 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  26.09 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  26.51 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  29.59 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  29.27 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>