More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1561 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  100 
 
 		 293 aa  599  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  56.36 
 
 		 301 aa  344  8.999999999999999e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  55.67 
 
 		 301 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  55.67 
 
 		 301 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  55.67 
 
 		 301 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  55.82 
 
 		 302 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  55.67 
 
 		 301 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  55.67 
 
 		 301 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  55.67 
 
 		 301 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  55.67 
 
 		 301 aa  342  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  55.67 
 
 		 301 aa  342  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  55.82 
 
 		 302 aa  340  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  55.33 
 
 		 301 aa  340  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  54.3 
 
 		 301 aa  338  8e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  52.92 
 
 		 300 aa  331  7.000000000000001e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  53.08 
 
 		 305 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  53.95 
 
 		 303 aa  323  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  51.72 
 
 		 299 aa  322  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  51.72 
 
 		 299 aa  322  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  52.58 
 
 		 298 aa  322  6e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  51.38 
 
 		 302 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  51.2 
 
 		 294 aa  317  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  52.23 
 
 		 308 aa  316  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  50.86 
 
 		 303 aa  315  5e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  52.05 
 
 		 299 aa  315  7e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  54.3 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  52.07 
 
 		 301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  49.31 
 
 		 299 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  53.08 
 
 		 299 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  51.02 
 
 		 301 aa  310  1e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 298 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  51.37 
 
 		 300 aa  309  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  52.04 
 
 		 297 aa  305  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  51.72 
 
 		 303 aa  306  4.0000000000000004e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  49.66 
 
 		 303 aa  305  8.000000000000001e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  50.86 
 
 		 297 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 297 aa  301  9e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 298 aa  300  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  51.01 
 
 		 305 aa  297  2e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  48.29 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  47.95 
 
 		 296 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 300 aa  291  8e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  49.14 
 
 		 297 aa  288  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  48.45 
 
 		 306 aa  287  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  47.96 
 
 		 299 aa  287  2e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 		 301 aa  286  4e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  50.7 
 
 		 300 aa  285  8e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  50.7 
 
 		 301 aa  285  8e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  45.21 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  46.92 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  46.42 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  48.46 
 
 		 296 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  46.58 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  48.45 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  47 
 
 		 303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  47.95 
 
 		 298 aa  269  5e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  46.39 
 
 		 468 aa  266  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  48.28 
 
 		 449 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  46.62 
 
 		 318 aa  264  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  46.78 
 
 		 337 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  45.97 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  46.08 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  46.28 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  47.93 
 
 		 451 aa  259  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  46.64 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  44.14 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  43.34 
 
 		 301 aa  259  5.0000000000000005e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  44.97 
 
 		 314 aa  258  6e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  45.55 
 
 		 489 aa  258  9e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  43.77 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  44.18 
 
 		 303 aa  256  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  45.3 
 
 		 303 aa  255  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  43.34 
 
 		 315 aa  255  8e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1743  GTP-binding protein Era  47.26 
 
 		 293 aa  254  8e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  45.76 
 
 		 314 aa  254  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  43.71 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  43.71 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  43.92 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  45.76 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  43.58 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  45 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  43.84 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  45.73 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  46.64 
 
 		 318 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  43.73 
 
 		 310 aa  252  6e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  42.27 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  42.9 
 
 		 314 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  44.22 
 
 		 300 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1752  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 		 312 aa  249  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  43.54 
 
 		 303 aa  249  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  43.88 
 
 		 298 aa  248  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  45.08 
 
 		 303 aa  248  9e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2851  GTP-binding protein Era  45.33 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  43.88 
 
 		 306 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  43.65 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  43.54 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1511  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  47.12 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  43.34 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>