More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0614 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 135 aa  267  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  76.74 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  60.15 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  58.78 
 
 		 137 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  60.63 
 
 		 136 aa  157  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  58.78 
 
 		 142 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  59.68 
 
 		 128 aa  154  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  55.38 
 
 		 138 aa  151  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  59.06 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  59.06 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  58.27 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  57.25 
 
 		 144 aa  150  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  59.06 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  54.48 
 
 		 347 aa  150  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  53.33 
 
 		 138 aa  149  8.999999999999999e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  53.33 
 
 		 138 aa  149  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  56 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  58.78 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  58.06 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  61.67 
 
 		 138 aa  147  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  55.91 
 
 		 132 aa  147  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  57.36 
 
 		 134 aa  145  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  55.81 
 
 		 133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  59.02 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  57.38 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  58.06 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  57.6 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  55.04 
 
 		 133 aa  143  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  56.2 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  60.68 
 
 		 138 aa  140  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  60.68 
 
 		 138 aa  140  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  55.22 
 
 		 150 aa  139  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  58.97 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  57.5 
 
 		 135 aa  135  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  59.83 
 
 		 138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  57.26 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  51.67 
 
 		 137 aa  130  6.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  51.2 
 
 		 334 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  54.07 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  46.88 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  43.31 
 
 		 318 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  45.9 
 
 		 315 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  45.9 
 
 		 315 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  45.97 
 
 		 129 aa  94.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  44.72 
 
 		 310 aa  93.6  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  44.78 
 
 		 320 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.94 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.94 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.94 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  44.03 
 
 		 320 aa  91.7  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  42.06 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  45.9 
 
 		 313 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  40.5 
 
 		 150 aa  90.1  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 129 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  42.74 
 
 		 314 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  44.25 
 
 		 306 aa  89.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.77 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  42.74 
 
 		 314 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  44.26 
 
 		 314 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.4 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.21 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.41 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.4 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.4 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  43.44 
 
 		 316 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.88 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.6 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.6 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  42.74 
 
 		 314 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.41 
 
 		 135 aa  87  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.19 
 
 		 135 aa  87  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  46.22 
 
 		 148 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  43.44 
 
 		 313 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.41 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  36.8 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  42.62 
 
 		 316 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  42.15 
 
 		 312 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  41.41 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.41 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.8 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.41 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.8 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  42.97 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  41.67 
 
 		 130 aa  84.3  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  43.7 
 
 		 383 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  39.52 
 
 		 314 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.23 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  38.98 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  35.38 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>