146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38940 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  100 
 
 		 286 aa  585  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6974  MaoC domain protein dehydratase  55.64 
 
 		 267 aa  268  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  50.51 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  51.4 
 
 		 297 aa  255  7e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0146  dehydratase  51.92 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861571  decreased coverage  0.0000240434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0308  MaoC domain protein dehydratase  48.97 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  50 
 
 		 288 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  44.33 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1388  dehydratase  41.53 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000424588  unclonable  0.000000000439784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3017  MaoC domain-containing protein dehydratase  46.07 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176864  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5510  hypothetical protein  46.48 
 
 		 285 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1070  MaoC-like dehydratase  39.67 
 
 		 305 aa  208  9e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000325805  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0742  dehydratase  44.72 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.780848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  47.04 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1308  hypothetical protein  38.61 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000275009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63290  hypothetical protein  48.41 
 
 		 285 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2380  MaoC domain protein dehydratase  41.39 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3315  dehydratase  41.79 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000241426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3750  MaoC domain protein dehydratase  40.35 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0600605  normal  0.381685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4584  dehydratase  44.79 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3587  MaoC domain protein dehydratase  43.14 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0611  dehydratase  41.4 
 
 		 288 aa  196  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000129975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4026  MaoC domain protein dehydratase  41.84 
 
 		 292 aa  195  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.123863 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2077  dehydratase  41.34 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0559  dehydratase  40.35 
 
 		 287 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3471  dehydratase  40.35 
 
 		 287 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0558  dehydratase  40.35 
 
 		 287 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4455  MaoC domain protein dehydratase  42.27 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00945579  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0518  dehydratase  40.36 
 
 		 276 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177397  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3806  dehydratase  40.36 
 
 		 276 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000417553  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  43.58 
 
 		 283 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23460  acyl dehydratase  41 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260821  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0580  MaoC domain-containing protein  43.58 
 
 		 283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3932  dehydratase  40 
 
 		 276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  43.01 
 
 		 286 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0559  MaoC domain-containing protein  40 
 
 		 276 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1893  MaoC domain protein dehydratase  40.48 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4341  dehydratase  38.81 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34970  acyl dehydratase  38.74 
 
 		 339 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  41.64 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0625  dehydratase  42.41 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406567 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3522  dehydratase  38.11 
 
 		 288 aa  185  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10244  hypothetical protein  41.63 
 
 		 280 aa  185  9e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0093701  normal  0.943124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3721  dehydratase  38.46 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000101981  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3115  MaoC domain protein dehydratase  36.73 
 
 		 333 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  40.93 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3148  MaoC domain-containing protein  39.65 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  40.93 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  40.93 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0430  MaoC domain protein dehydratase  40.91 
 
 		 306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0524  MaoC-like dehydratase  37.76 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449112  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  42.91 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2776  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  38.03 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272996  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0258  dehydratase  39.38 
 
 		 284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115215 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  41.57 
 
 		 284 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  38.93 
 
 		 294 aa  175  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2146  dehydratase  38.46 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0441  dehydratase  39.15 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000513118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0413  dehydratase  38.61 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0697277 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1674  MaoC domain protein dehydratase  38.68 
 
 		 314 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  41.92 
 
 		 284 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0415  MaoC domain protein dehydratase  40.97 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134356 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  36.94 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21230  acyl dehydratase  40 
 
 		 335 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11740  MaoC-like protein  37.71 
 
 		 297 aa  165  5.9999999999999996e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0694748  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3157  MaoC-like dehydratase  35.16 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00547969  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1702  dehydratase  38.73 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00665806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  31.5 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3954  dehydratase  29.32 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3316  hypothetical protein  30.93 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2103  hypothetical protein  29.02 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0785743  normal  0.016568 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0535  putative signal peptide protein  43.18 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.186468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  32.64 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  39.08 
 
 		 138 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  28.72 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  43.94 
 
 		 127 aa  52.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1994  MaoC domain protein dehydratase  30.21 
 
 		 3083 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  29.19 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  29.03 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  44.44 
 
 		 144 aa  49.7  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1493  dehydratase  41.18 
 
 		 156 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  44.78 
 
 		 144 aa  48.9  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  41.54 
 
 		 156 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1594  dehydratase  38.89 
 
 		 161 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.691822  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 710 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  40.28 
 
 		 147 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  40.28 
 
 		 147 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  40.28 
 
 		 147 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  36.76 
 
 		 156 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  35.16 
 
 		 156 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  42.86 
 
 		 156 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6218  dehydratase  38.89 
 
 		 177 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  38.24 
 
 		 156 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3031  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  41.27 
 
 		 471 aa  45.8  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  36.47 
 
 		 141 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  40.91 
 
 		 142 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0588  MaoC-like dehydratase  39.06 
 
 		 147 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2915  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  44.83 
 
 		 473 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2693  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  44.83 
 
 		 473 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5194  dehydratase  36.76 
 
 		 154 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0490486 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>