177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0625 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0625  dehydratase  100 
 
 		 283 aa  577  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  90.46 
 
 		 283 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0580  MaoC domain-containing protein  90.46 
 
 		 283 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4584  dehydratase  81.63 
 
 		 283 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  57.5 
 
 		 284 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  54.29 
 
 		 286 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  53.21 
 
 		 285 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5510  hypothetical protein  53.71 
 
 		 285 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0742  dehydratase  51.43 
 
 		 285 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.780848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63290  hypothetical protein  53.71 
 
 		 285 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  41.26 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0308  MaoC domain protein dehydratase  44.03 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  41.41 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  43.46 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  45.7 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0146  dehydratase  43.64 
 
 		 306 aa  168  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861571  decreased coverage  0.0000240434 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1308  hypothetical protein  39.41 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000275009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  41.46 
 
 		 300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  43.2 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2077  dehydratase  38.52 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1070  MaoC-like dehydratase  40.36 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000325805  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2776  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  40.82 
 
 		 311 aa  161  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272996  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4026  MaoC domain protein dehydratase  39.55 
 
 		 292 aa  162  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.123863 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21230  acyl dehydratase  39.02 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1674  MaoC domain protein dehydratase  39.92 
 
 		 314 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6974  MaoC domain protein dehydratase  43.55 
 
 		 267 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1388  dehydratase  38.66 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000424588  unclonable  0.000000000439784 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  43.98 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34970  acyl dehydratase  40.16 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  42.52 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3115  MaoC domain protein dehydratase  40.59 
 
 		 333 aa  149  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3017  MaoC domain-containing protein dehydratase  40 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176864  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2380  MaoC domain protein dehydratase  39.45 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3157  MaoC-like dehydratase  40.19 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00547969  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3587  MaoC domain protein dehydratase  41.57 
 
 		 311 aa  142  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2146  dehydratase  38.67 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0430  MaoC domain protein dehydratase  37.4 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4455  MaoC domain protein dehydratase  37.87 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00945579  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11740  MaoC-like protein  36.3 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0694748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23460  acyl dehydratase  40.59 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260821  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0558  dehydratase  31.67 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0524  MaoC-like dehydratase  33.89 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449112  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0559  MaoC domain-containing protein  32.46 
 
 		 276 aa  132  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0559  dehydratase  31.77 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3471  dehydratase  31.77 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  37.89 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3806  dehydratase  32.09 
 
 		 276 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000417553  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3750  MaoC domain protein dehydratase  31.41 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0600605  normal  0.381685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0518  dehydratase  32.09 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177397  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3932  dehydratase  32.09 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0413  dehydratase  36.16 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0697277 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3522  dehydratase  35.08 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1702  dehydratase  36.59 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00665806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  34.39 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3315  dehydratase  32.46 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000241426  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  37.27 
 
 		 280 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1893  MaoC domain protein dehydratase  38.18 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  33.99 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  33.99 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10244  hypothetical protein  34.75 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0093701  normal  0.943124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0415  MaoC domain protein dehydratase  37.16 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134356 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0441  dehydratase  32.77 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000513118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3148  MaoC domain-containing protein  31.35 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3721  dehydratase  33.76 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000101981  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0258  dehydratase  33.78 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0611  dehydratase  33.33 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000129975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  32.02 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4341  dehydratase  31.71 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3954  dehydratase  28.35 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3316  hypothetical protein  27.98 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  38.02 
 
 		 141 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2103  hypothetical protein  27.16 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0785743  normal  0.016568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  36.79 
 
 		 127 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  34.86 
 
 		 156 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1633  (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase  29.77 
 
 		 3172 aa  52.8  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  34.86 
 
 		 156 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5041  dehydratase  37.93 
 
 		 157 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0522475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  35.29 
 
 		 173 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  33.9 
 
 		 142 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  34.12 
 
 		 156 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5194  dehydratase  35.87 
 
 		 154 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  35.63 
 
 		 140 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  39.56 
 
 		 142 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  35.29 
 
 		 156 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  35.29 
 
 		 156 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1594  dehydratase  35.14 
 
 		 161 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.691822  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  39.13 
 
 		 138 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  35.29 
 
 		 156 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0115  MaoC domain protein dehydratase  31.25 
 
 		 141 aa  49.7  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.527256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  41.89 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  35.29 
 
 		 156 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3642  MaoC domain protein dehydratase  36.78 
 
 		 157 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.023327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3444  dehydratase  36.78 
 
 		 157 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.523272  normal  0.0613814 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1493  dehydratase  37.21 
 
 		 156 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3753  MaoC domain protein dehydratase  36.78 
 
 		 157 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5970  MaoC domain protein dehydratase  35.23 
 
 		 155 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0874793  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  34.78 
 
 		 144 aa  48.9  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  34.78 
 
 		 142 aa  48.9  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  38.46 
 
 		 142 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  37.18 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>