139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21230 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_21230  acyl dehydratase  100 
 
 
335 aa  655    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0308  MaoC domain protein dehydratase  50.19 
 
 
284 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  37.66 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3587  MaoC domain protein dehydratase  40.59 
 
 
311 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34970  acyl dehydratase  40.07 
 
 
339 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4026  MaoC domain protein dehydratase  40.38 
 
 
292 aa  169  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.123863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  38.08 
 
 
297 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0146  dehydratase  43.44 
 
 
306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861571  decreased coverage  0.0000240434 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1070  MaoC-like dehydratase  33.84 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000325805  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  41.53 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  39.1 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1308  hypothetical protein  33.58 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000275009  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  42.06 
 
 
283 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  43.36 
 
 
297 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3115  MaoC domain protein dehydratase  37.57 
 
 
333 aa  160  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  36.93 
 
 
285 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0625  dehydratase  39.02 
 
 
283 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4584  dehydratase  38.58 
 
 
283 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  40.51 
 
 
286 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0580  MaoC domain-containing protein  40.08 
 
 
283 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0742  dehydratase  39.62 
 
 
285 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.780848  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2776  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  37.76 
 
 
311 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272996  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2146  dehydratase  41.45 
 
 
307 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2380  MaoC domain protein dehydratase  38.51 
 
 
317 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.087809 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1388  dehydratase  34.5 
 
 
298 aa  151  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000424588  unclonable  0.000000000439784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6974  MaoC domain protein dehydratase  41.99 
 
 
267 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5510  hypothetical protein  35.97 
 
 
285 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0430  MaoC domain protein dehydratase  38.49 
 
 
306 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  38.49 
 
 
300 aa  150  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63290  hypothetical protein  38.71 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230888  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1674  MaoC domain protein dehydratase  38.49 
 
 
314 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3017  MaoC domain-containing protein dehydratase  38.84 
 
 
285 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176864  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3157  MaoC-like dehydratase  30.84 
 
 
320 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00547969  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1893  MaoC domain protein dehydratase  39.19 
 
 
335 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2077  dehydratase  34.49 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1702  dehydratase  37.89 
 
 
305 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00665806  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0415  MaoC domain protein dehydratase  39.92 
 
 
306 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4341  dehydratase  32.65 
 
 
294 aa  132  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23460  acyl dehydratase  37.69 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260821  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0611  dehydratase  32.95 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000129975  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11740  MaoC-like protein  34.69 
 
 
297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0694748  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  39.46 
 
 
284 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  39.32 
 
 
280 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3721  dehydratase  31.34 
 
 
288 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000101981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  41.2 
 
 
284 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3750  MaoC domain protein dehydratase  30.5 
 
 
287 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0600605  normal  0.381685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  33.05 
 
 
281 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  33.05 
 
 
281 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10244  hypothetical protein  34.2 
 
 
280 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0093701  normal  0.943124 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  38.29 
 
 
284 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  33.05 
 
 
281 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  34.8 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0524  MaoC-like dehydratase  29.9 
 
 
289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449112  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0558  dehydratase  29.82 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0518  dehydratase  30.11 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0559  MaoC domain-containing protein  30.6 
 
 
276 aa  120  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0559  dehydratase  31.4 
 
 
287 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3471  dehydratase  31.4 
 
 
287 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3806  dehydratase  29.75 
 
 
276 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000417553  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0258  dehydratase  31.86 
 
 
284 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.115215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3148  MaoC domain-containing protein  31.03 
 
 
287 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113837  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4455  MaoC domain protein dehydratase  35.62 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00945579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3932  dehydratase  29.75 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212138  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3315  dehydratase  30.71 
 
 
276 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000241426  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0441  dehydratase  29.43 
 
 
279 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000513118  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0413  dehydratase  30.87 
 
 
282 aa  116  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0697277 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3522  dehydratase  32.36 
 
 
288 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  31.06 
 
 
291 aa  105  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3954  dehydratase  28.99 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  30.43 
 
 
279 aa  62.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3316  hypothetical protein  26.34 
 
 
297 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2103  hypothetical protein  25.49 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0785743  normal  0.016568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  34.31 
 
 
142 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  44.78 
 
 
142 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  33.68 
 
 
144 aa  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0535  putative signal peptide protein  40 
 
 
152 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.186468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  40.24 
 
 
141 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4044  MaoC-like dehydratase  34.02 
 
 
155 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738131  normal  0.82003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  36.78 
 
 
127 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  43.28 
 
 
130 aa  50.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  43.28 
 
 
130 aa  49.7  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  39.78 
 
 
155 aa  49.3  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1081  dehydratase  28.92 
 
 
135 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  36.71 
 
 
157 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1355  acyl dehydratase  34.29 
 
 
142 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0115  MaoC domain protein dehydratase  48.94 
 
 
141 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.527256  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  37.36 
 
 
142 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  35.8 
 
 
133 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  46.77 
 
 
131 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1493  dehydratase  37.5 
 
 
156 aa  47  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0447243  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  38.04 
 
 
142 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3797  dehydratase  36.23 
 
 
132 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  33.77 
 
 
352 aa  46.2  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  35.62 
 
 
134 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  37.31 
 
 
144 aa  46.2  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  32.52 
 
 
142 aa  46.2  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1242  acyl dehydratase  28 
 
 
142 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5041  dehydratase  50 
 
 
157 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0522475  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3642  MaoC domain protein dehydratase  50 
 
 
157 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.023327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3753  MaoC domain protein dehydratase  50 
 
 
157 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>