90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2146 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2146  dehydratase  100 
 
 
307 aa  620  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1893  MaoC domain protein dehydratase  74.75 
 
 
335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109024 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  50.5 
 
 
300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3587  MaoC domain protein dehydratase  47.51 
 
 
311 aa  245  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34970  acyl dehydratase  46.31 
 
 
339 aa  235  8e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2380  MaoC domain protein dehydratase  43.97 
 
 
317 aa  232  7.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.087809 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3115  MaoC domain protein dehydratase  44.58 
 
 
333 aa  226  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23460  acyl dehydratase  38.76 
 
 
301 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260821  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11740  MaoC-like protein  39.4 
 
 
297 aa  179  7e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0694748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0308  MaoC domain protein dehydratase  38.91 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  39.06 
 
 
286 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4026  MaoC domain protein dehydratase  39.37 
 
 
292 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.123863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  37.83 
 
 
297 aa  159  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0146  dehydratase  35.43 
 
 
306 aa  155  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861571  decreased coverage  0.0000240434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  37.41 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21230  acyl dehydratase  41.63 
 
 
335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  35.32 
 
 
297 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1070  MaoC-like dehydratase  32.21 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000325805  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  36.3 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6974  MaoC domain protein dehydratase  36.3 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  39.73 
 
 
283 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1308  hypothetical protein  31.69 
 
 
305 aa  143  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000275009  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4584  dehydratase  35.09 
 
 
283 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1388  dehydratase  31.09 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000424588  unclonable  0.000000000439784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0625  dehydratase  36.36 
 
 
283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0580  MaoC domain-containing protein  38.77 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  37.31 
 
 
285 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63290  hypothetical protein  34.26 
 
 
285 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230888  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0742  dehydratase  32.86 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.780848  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4455  MaoC domain protein dehydratase  33.72 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00945579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5510  hypothetical protein  33.59 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3017  MaoC domain-containing protein dehydratase  32.37 
 
 
285 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176864  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3157  MaoC-like dehydratase  29.93 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00547969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2077  dehydratase  31.5 
 
 
291 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2776  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  31.99 
 
 
311 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272996  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1674  MaoC domain protein dehydratase  32.97 
 
 
314 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  32.72 
 
 
284 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  32.83 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0524  MaoC-like dehydratase  30.47 
 
 
289 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449112  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  31.46 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  31.46 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0258  dehydratase  30.97 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.115215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0430  MaoC domain protein dehydratase  31.3 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  32.3 
 
 
294 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  33.48 
 
 
284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  34.25 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  31.09 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0413  dehydratase  30.71 
 
 
282 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0697277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10244  hypothetical protein  32.67 
 
 
280 aa  113  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0093701  normal  0.943124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0441  dehydratase  29.33 
 
 
279 aa  112  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000513118  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4341  dehydratase  27.81 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3721  dehydratase  28.16 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000101981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3315  dehydratase  29.33 
 
 
276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000241426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3750  MaoC domain protein dehydratase  28.25 
 
 
287 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0600605  normal  0.381685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3522  dehydratase  28.48 
 
 
288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  31.82 
 
 
284 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0558  dehydratase  29.03 
 
 
287 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3471  dehydratase  28.01 
 
 
287 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0559  dehydratase  28.01 
 
 
287 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0518  dehydratase  27.95 
 
 
276 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0559  MaoC domain-containing protein  28.04 
 
 
276 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3932  dehydratase  27.95 
 
 
276 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212138  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0611  dehydratase  26.62 
 
 
288 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000129975  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1702  dehydratase  32.11 
 
 
305 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00665806  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3148  MaoC domain-containing protein  28.85 
 
 
287 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113837  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3806  dehydratase  27.61 
 
 
276 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000417553  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0415  MaoC domain protein dehydratase  30.21 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134356 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  31.4 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3316  hypothetical protein  26.25 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3954  dehydratase  28.24 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2103  hypothetical protein  21.5 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0785743  normal  0.016568 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  41.25 
 
 
138 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  43.08 
 
 
142 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  39.51 
 
 
142 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  42.47 
 
 
141 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  42.11 
 
 
127 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  48.39 
 
 
131 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1633  (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase  28.82 
 
 
3172 aa  47.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  43.08 
 
 
130 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  43.08 
 
 
130 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  43.08 
 
 
141 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  44.62 
 
 
155 aa  46.6  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  40 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  41.54 
 
 
142 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  43.08 
 
 
142 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  39.24 
 
 
142 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0535  putative signal peptide protein  27.14 
 
 
152 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.186468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  40 
 
 
142 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0370  MaoC domain protein dehydratase  36.84 
 
 
130 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.758804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  38.67 
 
 
142 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>