121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34970 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34970  acyl dehydratase  100 
 
 		 339 aa  662    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  51.05 
 
 		 300 aa  280  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3115  MaoC domain protein dehydratase  49.29 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3587  MaoC domain protein dehydratase  53.05 
 
 		 311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2380  MaoC domain protein dehydratase  47.97 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2146  dehydratase  48.16 
 
 		 307 aa  242  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1893  MaoC domain protein dehydratase  47.51 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109024 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23460  acyl dehydratase  44.03 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  38.33 
 
 		 286 aa  186  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11740  MaoC-like protein  38.87 
 
 		 297 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0694748  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  42.42 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0146  dehydratase  41.33 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861571  decreased coverage  0.0000240434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  38.89 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4455  MaoC domain protein dehydratase  39.31 
 
 		 296 aa  162  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00945579  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  40.49 
 
 		 288 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0308  MaoC domain protein dehydratase  40.12 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188637  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21230  acyl dehydratase  39.86 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1070  MaoC-like dehydratase  33.82 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000325805  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1388  dehydratase  30.24 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000424588  unclonable  0.000000000439784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  40.48 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0625  dehydratase  40.16 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4026  MaoC domain protein dehydratase  39.57 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.123863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0580  MaoC domain-containing protein  37.54 
 
 		 283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5510  hypothetical protein  35.78 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1308  hypothetical protein  32.35 
 
 		 305 aa  149  8e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000275009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  36.43 
 
 		 284 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  35.13 
 
 		 286 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63290  hypothetical protein  36.59 
 
 		 285 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4584  dehydratase  35.71 
 
 		 283 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0742  dehydratase  34.08 
 
 		 285 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.780848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6974  MaoC domain protein dehydratase  37.85 
 
 		 267 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  35.79 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0524  MaoC-like dehydratase  32.14 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449112  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  33.93 
 
 		 285 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  33.46 
 
 		 281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  33.46 
 
 		 281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3721  dehydratase  31.54 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000101981  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2776  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  36.97 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272996  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2077  dehydratase  32.51 
 
 		 291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  33.07 
 
 		 281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0611  dehydratase  33.21 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000129975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  35.69 
 
 		 284 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  36.06 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0413  dehydratase  32.95 
 
 		 282 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0697277 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3522  dehydratase  30.36 
 
 		 288 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10244  hypothetical protein  34.1 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0093701  normal  0.943124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  35.63 
 
 		 294 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3157  MaoC-like dehydratase  32.26 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00547969  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0258  dehydratase  32.93 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0430  MaoC domain protein dehydratase  36.27 
 
 		 306 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1674  MaoC domain protein dehydratase  37.5 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3017  MaoC domain-containing protein dehydratase  36.44 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176864  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3148  MaoC domain-containing protein  32.63 
 
 		 287 aa  122  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3315  dehydratase  29.33 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000241426  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3932  dehydratase  29.33 
 
 		 276 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0558  dehydratase  29.37 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3750  MaoC domain protein dehydratase  29.37 
 
 		 287 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0600605  normal  0.381685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0559  dehydratase  29.37 
 
 		 287 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3471  dehydratase  29.37 
 
 		 287 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0518  dehydratase  29 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0559  MaoC domain-containing protein  29.33 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3806  dehydratase  28.67 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000417553  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0441  dehydratase  29.51 
 
 		 279 aa  116  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000513118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4341  dehydratase  29.37 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1702  dehydratase  36.49 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00665806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  34.85 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  30.37 
 
 		 291 aa  109  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0415  MaoC domain protein dehydratase  34.74 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3954  dehydratase  28.06 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2103  hypothetical protein  26.92 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0785743  normal  0.016568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3316  hypothetical protein  25.88 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  42.42 
 
 		 142 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  38.57 
 
 		 142 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  42.68 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  39.51 
 
 		 155 aa  49.7  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  41.67 
 
 		 127 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  37.97 
 
 		 141 aa  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  35 
 
 		 339 aa  49.7  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  42.42 
 
 		 130 aa  49.7  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  46.75 
 
 		 131 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1594  dehydratase  36 
 
 		 161 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.691822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  31.34 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  36.71 
 
 		 138 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  42.42 
 
 		 130 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  38.1 
 
 		 133 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  40.91 
 
 		 141 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  38.67 
 
 		 134 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  40.91 
 
 		 144 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  40.91 
 
 		 144 aa  46.6  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  41.82 
 
 		 156 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  41.82 
 
 		 156 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  41.82 
 
 		 156 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  57.58 
 
 		 156 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  40.91 
 
 		 142 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1315  MaoC domain protein dehydratase  35.71 
 
 		 3102 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  39.39 
 
 		 142 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  50 
 
 		 156 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  40.91 
 
 		 142 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  44.62 
 
 		 156 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  38.24 
 
 		 150 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>