90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0559 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0559  MaoC domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  569  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0558  dehydratase  95.29 
 
 		 287 aa  554  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3471  dehydratase  95.29 
 
 		 287 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0559  dehydratase  95.29 
 
 		 287 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3750  MaoC domain protein dehydratase  88.77 
 
 		 287 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0600605  normal  0.381685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3932  dehydratase  89.13 
 
 		 276 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3806  dehydratase  88.77 
 
 		 276 aa  520  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000417553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3315  dehydratase  88.69 
 
 		 276 aa  521  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000241426  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0518  dehydratase  88.77 
 
 		 276 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3721  dehydratase  74.82 
 
 		 288 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000101981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0611  dehydratase  72.83 
 
 		 288 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000129975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4341  dehydratase  73.36 
 
 		 294 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3148  MaoC domain-containing protein  72.63 
 
 		 287 aa  424  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0524  MaoC-like dehydratase  70.07 
 
 		 289 aa  421  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449112  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0441  dehydratase  72.56 
 
 		 279 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000513118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3522  dehydratase  69.34 
 
 		 288 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1388  dehydratase  35.84 
 
 		 298 aa  194  9e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000424588  unclonable  0.000000000439784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2077  dehydratase  36.69 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  39.05 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  36.5 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  38.08 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  37.54 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0146  dehydratase  38.03 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861571  decreased coverage  0.0000240434 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  36 
 
 		 284 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  37.74 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1070  MaoC-like dehydratase  32.66 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000325805  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  35.64 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1308  hypothetical protein  31.99 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000275009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0308  MaoC domain protein dehydratase  35.13 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5510  hypothetical protein  38.11 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6974  MaoC domain protein dehydratase  40.32 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2776  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  32.85 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272996  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3157  MaoC-like dehydratase  33.45 
 
 		 320 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00547969  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1674  MaoC domain protein dehydratase  34.96 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3017  MaoC domain-containing protein dehydratase  34.39 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176864  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63290  hypothetical protein  37.7 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1702  dehydratase  34.63 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00665806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  36.05 
 
 		 286 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  35.27 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  36.02 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0430  MaoC domain protein dehydratase  33.69 
 
 		 306 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0580  MaoC domain-containing protein  36.62 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  32.92 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  34.41 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0625  dehydratase  32.46 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0742  dehydratase  31.27 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.780848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  33.59 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4584  dehydratase  33.61 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  33.2 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  33.2 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2380  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087809 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0415  MaoC domain protein dehydratase  32.03 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  30.5 
 
 		 300 aa  122  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23460  acyl dehydratase  31.76 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260821  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3115  MaoC domain protein dehydratase  32.77 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21230  acyl dehydratase  31.66 
 
 		 335 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10244  hypothetical protein  30.27 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0093701  normal  0.943124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34970  acyl dehydratase  29.82 
 
 		 339 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0258  dehydratase  29.8 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0413  dehydratase  28.63 
 
 		 282 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0697277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1893  MaoC domain protein dehydratase  30.11 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109024 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4026  MaoC domain protein dehydratase  29.43 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.123863 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4455  MaoC domain protein dehydratase  31.8 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00945579  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2146  dehydratase  30.17 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3587  MaoC domain protein dehydratase  29.96 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  31.92 
 
 		 294 aa  99.4  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  29.07 
 
 		 291 aa  94  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11740  MaoC-like protein  28.57 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0694748  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3316  hypothetical protein  25.1 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3954  dehydratase  22.92 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2103  hypothetical protein  24.16 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0785743  normal  0.016568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  34.95 
 
 		 141 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  35.11 
 
 		 144 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  38.24 
 
 		 142 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  34.67 
 
 		 157 aa  46.6  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  25.61 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  35.14 
 
 		 127 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  36.71 
 
 		 134 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  36.36 
 
 		 142 aa  46.2  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  35.29 
 
 		 141 aa  46.2  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  34.78 
 
 		 142 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  40.68 
 
 		 133 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  36.23 
 
 		 137 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  37.88 
 
 		 142 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  31.82 
 
 		 150 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  37.88 
 
 		 130 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  37.88 
 
 		 130 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  36.36 
 
 		 144 aa  42.7  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  36.76 
 
 		 155 aa  42.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  36.99 
 
 		 138 aa  42.4  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>