119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2380 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2380  MaoC domain protein dehydratase  100 
 
 
317 aa  633  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.087809 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  49.67 
 
 
300 aa  269  5e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3587  MaoC domain protein dehydratase  54.17 
 
 
311 aa  255  8e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34970  acyl dehydratase  47.38 
 
 
339 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3115  MaoC domain protein dehydratase  54.13 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2146  dehydratase  43.32 
 
 
307 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1893  MaoC domain protein dehydratase  42.49 
 
 
335 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  44.57 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23460  acyl dehydratase  41.38 
 
 
301 aa  189  5e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260821  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  40.55 
 
 
297 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11740  MaoC-like protein  40.52 
 
 
297 aa  177  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0694748  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  36.27 
 
 
297 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  44.1 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0146  dehydratase  39.59 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861571  decreased coverage  0.0000240434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0308  MaoC domain protein dehydratase  41.8 
 
 
284 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188637  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4455  MaoC domain protein dehydratase  36.86 
 
 
296 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00945579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0742  dehydratase  39.2 
 
 
285 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.780848  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4026  MaoC domain protein dehydratase  37.91 
 
 
292 aa  162  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.123863 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2077  dehydratase  35.23 
 
 
291 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  39.33 
 
 
284 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6974  MaoC domain protein dehydratase  41.92 
 
 
267 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1070  MaoC-like dehydratase  35.14 
 
 
305 aa  159  9e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000325805  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1388  dehydratase  36.06 
 
 
298 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000424588  unclonable  0.000000000439784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63290  hypothetical protein  41.26 
 
 
285 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230888  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5510  hypothetical protein  39.81 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  39.59 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21230  acyl dehydratase  39.7 
 
 
335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2776  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  42.54 
 
 
311 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272996  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  35.74 
 
 
281 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  35.74 
 
 
281 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1308  hypothetical protein  34.42 
 
 
305 aa  152  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000275009  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  35.74 
 
 
281 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0413  dehydratase  36.05 
 
 
282 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0697277 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4584  dehydratase  38.78 
 
 
283 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3157  MaoC-like dehydratase  35.06 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00547969  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0258  dehydratase  37 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.115215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0625  dehydratase  39.45 
 
 
283 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  35.35 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  40.27 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0580  MaoC domain-containing protein  39.82 
 
 
283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10244  hypothetical protein  36.82 
 
 
280 aa  145  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0093701  normal  0.943124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  35.74 
 
 
286 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1674  MaoC domain protein dehydratase  42.33 
 
 
314 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  41.86 
 
 
284 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3017  MaoC domain-containing protein dehydratase  38.67 
 
 
285 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176864  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  35.76 
 
 
284 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  40.64 
 
 
284 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1702  dehydratase  38.58 
 
 
305 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00665806  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3932  dehydratase  36.4 
 
 
276 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212138  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0430  MaoC domain protein dehydratase  37.71 
 
 
306 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3750  MaoC domain protein dehydratase  35.96 
 
 
287 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0600605  normal  0.381685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0518  dehydratase  35.96 
 
 
276 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177397  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3806  dehydratase  35.96 
 
 
276 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000417553  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0611  dehydratase  33.47 
 
 
288 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000129975  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3721  dehydratase  32.33 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000101981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4341  dehydratase  32.33 
 
 
294 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0524  MaoC-like dehydratase  30.88 
 
 
289 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449112  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0558  dehydratase  33.33 
 
 
287 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0559  MaoC domain-containing protein  33.33 
 
 
276 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0559  dehydratase  33.33 
 
 
287 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3471  dehydratase  33.33 
 
 
287 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3315  dehydratase  34.21 
 
 
276 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000241426  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3522  dehydratase  31.78 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  36.45 
 
 
280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0415  MaoC domain protein dehydratase  37.62 
 
 
306 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134356 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0441  dehydratase  32.36 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000513118  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3148  MaoC domain-containing protein  28.85 
 
 
287 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113837  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  29.81 
 
 
291 aa  109  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3954  dehydratase  23.46 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3316  hypothetical protein  28.07 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2103  hypothetical protein  24.71 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0785743  normal  0.016568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  42.03 
 
 
142 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  41.56 
 
 
141 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  37.5 
 
 
138 aa  52.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  38.89 
 
 
144 aa  52.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  44.62 
 
 
141 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  38.75 
 
 
127 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  43.42 
 
 
131 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  43.08 
 
 
142 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  46.38 
 
 
130 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  46.38 
 
 
130 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  41.54 
 
 
144 aa  50.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0535  putative signal peptide protein  33.73 
 
 
152 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.186468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  47.14 
 
 
279 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  41.54 
 
 
142 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  41.54 
 
 
142 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  34.57 
 
 
339 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1315  MaoC domain protein dehydratase  39.76 
 
 
3102 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  36.36 
 
 
343 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  36.36 
 
 
343 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  36.36 
 
 
343 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  41.54 
 
 
142 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  41.54 
 
 
142 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  44.78 
 
 
155 aa  46.2  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09408  Fatty acid synthase, beta subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78616]  53.06 
 
 
2093 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000212491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  40.62 
 
 
150 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  40 
 
 
142 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  48.94 
 
 
163 aa  45.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  40 
 
 
154 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  33.71 
 
 
352 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>