113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6974 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6974  MaoC domain protein dehydratase  100 
 
 
267 aa  523  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  54.65 
 
 
286 aa  275  7e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  44.78 
 
 
288 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  50.2 
 
 
297 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0146  dehydratase  51.41 
 
 
306 aa  212  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861571  decreased coverage  0.0000240434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  46.72 
 
 
297 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0308  MaoC domain protein dehydratase  48.26 
 
 
284 aa  201  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3017  MaoC domain-containing protein dehydratase  46.18 
 
 
285 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176864  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2077  dehydratase  42.34 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1070  MaoC-like dehydratase  39.68 
 
 
305 aa  186  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000325805  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4026  MaoC domain protein dehydratase  46.97 
 
 
292 aa  185  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.123863 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1308  hypothetical protein  39.53 
 
 
305 aa  183  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000275009  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1388  dehydratase  39.92 
 
 
298 aa  180  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000424588  unclonable  0.000000000439784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5510  hypothetical protein  42.19 
 
 
285 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63290  hypothetical protein  44.12 
 
 
285 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230888  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0580  MaoC domain-containing protein  45.97 
 
 
283 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0742  dehydratase  41.5 
 
 
285 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.780848  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0611  dehydratase  39.11 
 
 
288 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000129975  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  43.67 
 
 
286 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  41.2 
 
 
285 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2776  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  45.42 
 
 
311 aa  168  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272996  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  42.34 
 
 
284 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4341  dehydratase  38.62 
 
 
294 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0430  MaoC domain protein dehydratase  42.91 
 
 
306 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  44.61 
 
 
284 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2380  MaoC domain protein dehydratase  42.79 
 
 
317 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.087809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3721  dehydratase  38.8 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000101981  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  44.76 
 
 
283 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  43.49 
 
 
284 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  40.28 
 
 
300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4584  dehydratase  41.49 
 
 
283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0518  dehydratase  38.65 
 
 
276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177397  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3750  MaoC domain protein dehydratase  38.65 
 
 
287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0600605  normal  0.381685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0625  dehydratase  43.95 
 
 
283 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406567 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3806  dehydratase  38.65 
 
 
276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000417553  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1674  MaoC domain protein dehydratase  43.15 
 
 
314 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0558  dehydratase  38.87 
 
 
287 aa  162  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3932  dehydratase  38.3 
 
 
276 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212138  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0559  dehydratase  38.87 
 
 
287 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3471  dehydratase  38.87 
 
 
287 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  42.86 
 
 
284 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3522  dehydratase  36.8 
 
 
288 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0441  dehydratase  38.87 
 
 
279 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000513118  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3315  dehydratase  39.26 
 
 
276 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000241426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0415  MaoC domain protein dehydratase  41.82 
 
 
306 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134356 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23460  acyl dehydratase  44.4 
 
 
301 aa  159  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260821  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0559  MaoC domain-containing protein  40.65 
 
 
276 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3115  MaoC domain protein dehydratase  37.02 
 
 
333 aa  159  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  37.73 
 
 
281 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  37.36 
 
 
281 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  37.36 
 
 
281 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0413  dehydratase  35.77 
 
 
282 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0697277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21230  acyl dehydratase  42.73 
 
 
335 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3148  MaoC domain-containing protein  38.14 
 
 
287 aa  152  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113837  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0258  dehydratase  34.63 
 
 
284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.115215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4455  MaoC domain protein dehydratase  41.36 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00945579  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1893  MaoC domain protein dehydratase  37.45 
 
 
335 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109024 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0524  MaoC-like dehydratase  36.8 
 
 
289 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449112  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  40.34 
 
 
294 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3587  MaoC domain protein dehydratase  44.13 
 
 
311 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10244  hypothetical protein  37.4 
 
 
280 aa  145  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0093701  normal  0.943124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1702  dehydratase  42.18 
 
 
305 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00665806  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2146  dehydratase  36.84 
 
 
307 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3157  MaoC-like dehydratase  35.27 
 
 
320 aa  145  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00547969  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  40.99 
 
 
280 aa  135  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34970  acyl dehydratase  37.32 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  31.66 
 
 
291 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11740  MaoC-like protein  38.37 
 
 
297 aa  119  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0694748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3954  dehydratase  28.44 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3316  hypothetical protein  27.07 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0535  putative signal peptide protein  46.43 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.186468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2103  hypothetical protein  25.69 
 
 
294 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0785743  normal  0.016568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  43.94 
 
 
127 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  42.86 
 
 
144 aa  50.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  44.59 
 
 
131 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  37.8 
 
 
138 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  39.44 
 
 
157 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  42.86 
 
 
144 aa  46.6  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 
144 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1493  dehydratase  48.94 
 
 
156 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0447243  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  32.35 
 
 
156 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  37.78 
 
 
142 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1594  dehydratase  41.54 
 
 
161 aa  45.8  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.691822  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  37.86 
 
 
135 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  41.67 
 
 
142 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  30.92 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  40 
 
 
156 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  28.8 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  36.63 
 
 
155 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  38.57 
 
 
142 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 
620 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  31.68 
 
 
133 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  36.23 
 
 
154 aa  43.9  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  29.34 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1255  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  38.03 
 
 
473 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3648  fatty acid synthase  38.96 
 
 
3077 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3721  fatty acid synthase  38.96 
 
 
3077 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.875058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3661  fatty acid synthase  38.96 
 
 
3075 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.23097 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2693  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  38.03 
 
 
473 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>