85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34730 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  100 
 
 
302 aa  611  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  56.08 
 
 
258 aa  302  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  57.65 
 
 
267 aa  299  4e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  57.25 
 
 
263 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  51.74 
 
 
261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  51.17 
 
 
300 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  46.92 
 
 
262 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  51.82 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  50.79 
 
 
265 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  50.4 
 
 
319 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  46.24 
 
 
289 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  44.44 
 
 
258 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  45.49 
 
 
273 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  45.88 
 
 
255 aa  221  9e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  45.59 
 
 
287 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  44.19 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  45.31 
 
 
259 aa  220  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  47.62 
 
 
264 aa  218  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  45.56 
 
 
296 aa  218  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  45.82 
 
 
255 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  43.68 
 
 
326 aa  206  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  44.36 
 
 
297 aa  205  6e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  41 
 
 
333 aa  205  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  42.22 
 
 
266 aa  202  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  43.22 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  43.31 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  43.08 
 
 
294 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  40.43 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  41.83 
 
 
290 aa  196  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  38.87 
 
 
301 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  41.3 
 
 
257 aa  185  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  42.57 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  41.67 
 
 
281 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  39.48 
 
 
307 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  42.28 
 
 
283 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  42.19 
 
 
270 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.69 
 
 
258 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  39.3 
 
 
256 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  37.98 
 
 
256 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  39.3 
 
 
256 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  36.72 
 
 
254 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  39.13 
 
 
254 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  37.19 
 
 
262 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  32.46 
 
 
196 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  32.42 
 
 
196 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  30.77 
 
 
197 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  31.87 
 
 
197 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  32.98 
 
 
210 aa  92.8  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  30.22 
 
 
211 aa  92.8  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  31.32 
 
 
197 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  30.22 
 
 
197 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  30.22 
 
 
197 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  30.22 
 
 
211 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.11 
 
 
218 aa  89.4  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.72 
 
 
270 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  33.5 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  29.71 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  35.09 
 
 
143 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  32.14 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  32.14 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  31.58 
 
 
218 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  32.47 
 
 
232 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  27.09 
 
 
368 aa  57.4  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  30.99 
 
 
324 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  30.22 
 
 
249 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  31.31 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  30.77 
 
 
247 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  30.22 
 
 
240 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  27.8 
 
 
329 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
305 aa  53.1  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  29.84 
 
 
343 aa  52.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  27.96 
 
 
189 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  26.92 
 
 
244 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  24.46 
 
 
216 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  26.23 
 
 
213 aa  46.6  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0503  lipase/acylhydrolase  29.79 
 
 
279 aa  45.8  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  28.95 
 
 
209 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  29.3 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2484  lipolytic protein G-D-S-L family  27.06 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  24.64 
 
 
188 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.07 
 
 
270 aa  42.4  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  33.63 
 
 
202 aa  42.4  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  29.41 
 
 
267 aa  42.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  28.88 
 
 
267 aa  42.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  29.41 
 
 
267 aa  42.4  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>