More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17700 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  73.29 
 
 		 491 aa  663    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  100 
 
 		 498 aa  981    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  68.89 
 
 		 494 aa  631  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  69.39 
 
 		 495 aa  632  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  70.16 
 
 		 527 aa  619  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  70.48 
 
 		 490 aa  619  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  66.19 
 
 		 476 aa  596  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  63.28 
 
 		 486 aa  548  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  61.94 
 
 		 501 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  60.04 
 
 		 511 aa  518  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  58.5 
 
 		 509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  58.47 
 
 		 521 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0309  cobyric acid synthase  60.29 
 
 		 501 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  54.24 
 
 		 529 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  57.86 
 
 		 512 aa  500  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  57.62 
 
 		 575 aa  501  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  58.04 
 
 		 509 aa  495  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  56.94 
 
 		 509 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2603  cobyric acid synthase  56.13 
 
 		 520 aa  473  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.478422  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  56.69 
 
 		 508 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  52.35 
 
 		 507 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2034  cobyric acid synthase  55.06 
 
 		 495 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2051  cobyric acid synthase  55.06 
 
 		 495 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2097  cobyric acid synthase  55.06 
 
 		 495 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0722506  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  50.69 
 
 		 517 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  55.35 
 
 		 499 aa  444  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  52.24 
 
 		 485 aa  425  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  48.36 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  46.14 
 
 		 489 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  38.54 
 
 		 494 aa  382  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  43.45 
 
 		 517 aa  378  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  48.07 
 
 		 490 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  44.49 
 
 		 500 aa  379  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  47.46 
 
 		 490 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  47.1 
 
 		 483 aa  372  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  43.81 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  46.5 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  48.57 
 
 		 481 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  41.57 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0323  cobyric acid synthase  48.08 
 
 		 491 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  48.57 
 
 		 481 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  45.81 
 
 		 483 aa  369  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  43.35 
 
 		 491 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  41.51 
 
 		 536 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  41.03 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  41.22 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  43.12 
 
 		 485 aa  369  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  46.36 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  41.22 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  41.42 
 
 		 506 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  46.61 
 
 		 485 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  45.08 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  41.22 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  44.86 
 
 		 487 aa  365  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  45.08 
 
 		 484 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  46.19 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  47.11 
 
 		 510 aa  365  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  47.22 
 
 		 496 aa  364  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  43.5 
 
 		 508 aa  364  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  42.62 
 
 		 485 aa  364  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  46.15 
 
 		 488 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  42.24 
 
 		 491 aa  363  3e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  45.4 
 
 		 506 aa  363  5.0000000000000005e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  43.81 
 
 		 502 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  38.79 
 
 		 513 aa  361  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  45.85 
 
 		 481 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  44.53 
 
 		 502 aa  361  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  44.03 
 
 		 484 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  48.14 
 
 		 477 aa  360  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  48.67 
 
 		 481 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  46.71 
 
 		 495 aa  358  9e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  45.3 
 
 		 486 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  45.34 
 
 		 498 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  47.99 
 
 		 496 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  41.44 
 
 		 484 aa  355  6.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  44.26 
 
 		 491 aa  355  8.999999999999999e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  43.94 
 
 		 484 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0815  cobyric acid synthase CobQ  47.76 
 
 		 483 aa  355  1e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  45.53 
 
 		 486 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  45.1 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  38.65 
 
 		 514 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2756  cobyric acid synthase  46.75 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  45.92 
 
 		 545 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  46.06 
 
 		 501 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  45.92 
 
 		 535 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  45.92 
 
 		 512 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  45.92 
 
 		 523 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  45.92 
 
 		 531 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  45.92 
 
 		 529 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  45.92 
 
 		 585 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  45.03 
 
 		 505 aa  351  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  41.53 
 
 		 475 aa  352  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  40.34 
 
 		 541 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  44.47 
 
 		 481 aa  351  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  46.27 
 
 		 484 aa  351  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  42.26 
 
 		 539 aa  351  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  46.15 
 
 		 511 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  45.93 
 
 		 520 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  40.25 
 
 		 488 aa  349  6e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  39.81 
 
 		 541 aa  349  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>