More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13620 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 300 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  83.39 
 
 		 298 aa  517  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  73.24 
 
 		 306 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2116  GTP-binding protein Era  73.67 
 
 		 310 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  72.54 
 
 		 299 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  72.11 
 
 		 311 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  72.85 
 
 		 303 aa  443  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  69.67 
 
 		 300 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1271  GTP-binding protein Era  72.48 
 
 		 307 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2203  GTP-binding protein Era  71.38 
 
 		 306 aa  437  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.00609862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7045  GTP-binding protein Era  69.74 
 
 		 375 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  70.51 
 
 		 315 aa  428  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  69.31 
 
 		 314 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3384  GTP-binding protein Era  70.39 
 
 		 308 aa  425  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731226  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  67.11 
 
 		 304 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  70.07 
 
 		 297 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  67.45 
 
 		 299 aa  417  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  68.79 
 
 		 322 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  67.55 
 
 		 305 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3452  GTP-binding protein Era  67.11 
 
 		 299 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00911502  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3515  GTP-binding protein Era  67.11 
 
 		 299 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  67.33 
 
 		 314 aa  411  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  66.45 
 
 		 319 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2229  GTP-binding protein Era  65.46 
 
 		 318 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1919  GTP-binding protein Era  69.31 
 
 		 313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247131  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  66.45 
 
 		 302 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  63.46 
 
 		 298 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  62.13 
 
 		 310 aa  395  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2185  GTP-binding protein Era  65.81 
 
 		 319 aa  397  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646134  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  62.38 
 
 		 318 aa  391  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12390  GTP-binding protein Era  66.78 
 
 		 300 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1752  GTP-binding protein Era  63.21 
 
 		 312 aa  388  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12310  GTP-binding protein Era  65.58 
 
 		 321 aa  378  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  61.34 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1580  GTP-binding protein Era  66.79 
 
 		 272 aa  360  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116629  normal  0.081764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1662  GTP-binding protein Era  60.54 
 
 		 305 aa  340  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.438796  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0861  GTP-binding protein Era  50.8 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0593  GTP-binding protein Era  48.55 
 
 		 354 aa  294  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  48.81 
 
 		 302 aa  289  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  46.46 
 
 		 299 aa  288  8e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  46.46 
 
 		 299 aa  288  8e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  46.13 
 
 		 299 aa  285  7e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  47.16 
 
 		 300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  46.33 
 
 		 301 aa  279  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  46.33 
 
 		 301 aa  279  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  46.33 
 
 		 301 aa  279  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  46.33 
 
 		 301 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  46.33 
 
 		 301 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  46 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  46 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  45.67 
 
 		 301 aa  275  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  45.67 
 
 		 301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  44 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  44.67 
 
 		 301 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  47.33 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  46.33 
 
 		 302 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  46.33 
 
 		 302 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  46.96 
 
 		 308 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  46.78 
 
 		 301 aa  267  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  47.8 
 
 		 307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  44.93 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  47 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  41.02 
 
 		 302 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  43.92 
 
 		 297 aa  258  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  43.24 
 
 		 303 aa  255  6e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  41.02 
 
 		 298 aa  255  7e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  44.56 
 
 		 299 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  44.22 
 
 		 293 aa  249  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  43.88 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  43.96 
 
 		 303 aa  249  5e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  43.29 
 
 		 305 aa  248  8e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  44.56 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  41.81 
 
 		 303 aa  245  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  41.36 
 
 		 294 aa  244  9e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  42 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  40.54 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  41.84 
 
 		 296 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  40.53 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  42.33 
 
 		 298 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  44.82 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  41.5 
 
 		 296 aa  237  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  42 
 
 		 299 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  40.33 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  41.02 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2851  GTP-binding protein Era  45.92 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  46.43 
 
 		 343 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  38.59 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  41.2 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  41 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  37.16 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  41.5 
 
 		 314 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  40.2 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  40.73 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 		 489 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  38.51 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  46.51 
 
 		 451 aa  218  7.999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  35.12 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>