66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11140 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11140  uncharacterized AP superfamily protein  100 
 
 		 466 aa  946    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0415876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2330  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  68.78 
 
 		 467 aa  627  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1558  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  52.31 
 
 		 458 aa  487  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  53.83 
 
 		 455 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0983  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  52.84 
 
 		 459 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2289  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  48.68 
 
 		 456 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0787093 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2427  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  52.95 
 
 		 455 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7260  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  51.26 
 
 		 456 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000104438  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2469  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  52.93 
 
 		 467 aa  457  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00142832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2886  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  47.92 
 
 		 454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0426  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  47.48 
 
 		 450 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1148  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  48.97 
 
 		 461 aa  429  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0082  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  48.61 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0396  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  47.43 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0776  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.24 
 
 		 501 aa  242  9e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.62 
 
 		 496 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.65 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.4 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.75 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  19.73 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  21.36 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  19.35 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  19.94 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.16 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  19.35 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  18.83 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  18.83 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  19.89 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  19.89 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  19.89 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  19.07 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.71 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.67 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  25.96 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.89 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3720  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.82 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758068  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1468  hypothetical protein  27.47 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.45 
 
 		 456 aa  57  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.19 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  24.56 
 
 		 408 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0697  hypothetical protein  20.41 
 
 		 435 aa  55.1  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000533536  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2150  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.68 
 
 		 516 aa  53.5  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.284263  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4692  phosphonoacetate hydrolase  23.89 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5256  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.46 
 
 		 530 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  25.21 
 
 		 428 aa  52  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.872565 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  23.98 
 
 		 713 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0170  hypothetical protein  25.48 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305358  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  22.38 
 
 		 540 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2285  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.3 
 
 		 724 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2592  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.68 
 
 		 447 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1125  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.42 
 
 		 562 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3337  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.58 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912336 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9252  phosphonoacetate hydrolase  21.9 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  27.49 
 
 		 417 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  23.36 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  23.36 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  23.36 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  23.36 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  26.19 
 
 		 422 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17290  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.33 
 
 		 453 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4307  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.84 
 
 		 468 aa  43.9  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2169  phosphodiesterase I  24.7 
 
 		 433 aa  43.5  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4169  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.57 
 
 		 445 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  hitchhiker  0.00388008 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2080  phosphodiesterase I  24.7 
 
 		 433 aa  43.5  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1096  phosphonoacetate hydrolase  21.41 
 
 		 415 aa  43.1  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  26.75 
 
 		 268 aa  43.1  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>