153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0100 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0100  nitrate transporter  100 
 
 		 107 aa  204  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  48 
 
 		 404 aa  87.8  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  46 
 
 		 417 aa  85.9  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  46 
 
 		 403 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  46.08 
 
 		 406 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  45 
 
 		 404 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  47 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  45 
 
 		 414 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1735  major facilitator transporter  48 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  40 
 
 		 403 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  42 
 
 		 411 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  45 
 
 		 404 aa  77.8  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  41 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  42 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  44 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  44 
 
 		 411 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  44 
 
 		 403 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  39 
 
 		 403 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  46 
 
 		 403 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0594  nitrate transporter, putative  45.36 
 
 		 424 aa  64.3  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  45 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 400 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  45 
 
 		 403 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 418 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  42 
 
 		 403 aa  61.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1986  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 455 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.53952 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2211  major facilitator superfamily nitrate/nitrite transporter NarK/NasA  40 
 
 		 455 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3437  nitrate transporter  42 
 
 		 1046 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.293484  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2337  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 465 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  0.0352199 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  32.32 
 
 		 912 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 418 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  31.31 
 
 		 895 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 419 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  36.27 
 
 		 418 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 419 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  35 
 
 		 439 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  32.67 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  31.37 
 
 		 917 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 453 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1222  nitrate transporter, putative  42 
 
 		 606 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 421 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 418 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3401  major facilitator family transporter  42 
 
 		 468 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2441  nitrate transporter, putative  42 
 
 		 467 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 406 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  35.35 
 
 		 406 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0357  putative nitrate transporter  42 
 
 		 467 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1215  putative nitrate transporter  42 
 
 		 467 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3435  major facilitator family transporter  42 
 
 		 468 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 406 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2626  putative nitrate transporter  42 
 
 		 467 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 443 aa  54.3  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 435 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 421 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  30.3 
 
 		 422 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 397 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 460 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  34 
 
 		 414 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 390 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  30.39 
 
 		 428 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 440 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  32.32 
 
 		 431 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  32.32 
 
 		 431 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6173  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 438 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  29.41 
 
 		 435 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 420 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 438 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 438 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 424 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 418 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 398 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 441 aa  50.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 402 aa  50.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  29 
 
 		 417 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0245  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 453 aa  50.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.205061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  32.32 
 
 		 424 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 428 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  32.32 
 
 		 424 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  33 
 
 		 399 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  32.35 
 
 		 424 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 425 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 397 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 398 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  28.28 
 
 		 905 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 382 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 460 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 421 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0334  nitrate transporter  31.73 
 
 		 475 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000163846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 426 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 421 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 417 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 422 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10271  integral membrane nitrite extrusion protein narU (nitrite facilitator)  33.64 
 
 		 463 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0502374 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  26.73 
 
 		 426 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  26 
 
 		 420 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  26.73 
 
 		 426 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1233  nitrite extrusion protein 2  35.24 
 
 		 468 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  25.25 
 
 		 436 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>