More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3416 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  85.22 
 
 		 372 aa  650    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  85.22 
 
 		 372 aa  650    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 372 aa  747    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  85.22 
 
 		 372 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  90.86 
 
 		 374 aa  683    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  88.71 
 
 		 372 aa  666    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  85.22 
 
 		 372 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  84.14 
 
 		 372 aa  640    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  84.68 
 
 		 372 aa  624  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  83.92 
 
 		 369 aa  625  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  84.95 
 
 		 372 aa  625  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  85.22 
 
 		 372 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  84.68 
 
 		 372 aa  621  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  84.68 
 
 		 372 aa  621  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  82.8 
 
 		 379 aa  618  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  78.8 
 
 		 370 aa  595  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  64.29 
 
 		 369 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  64.09 
 
 		 377 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01162  gamma-glutamyl kinase  64.56 
 
 		 379 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004268  glutamate 5-kinase  64.01 
 
 		 379 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  62.6 
 
 		 367 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  62.6 
 
 		 367 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  62.6 
 
 		 367 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  61.37 
 
 		 367 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  62.6 
 
 		 367 aa  450  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  62.6 
 
 		 367 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  62.6 
 
 		 367 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  62.6 
 
 		 367 aa  450  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  62.6 
 
 		 367 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  62.6 
 
 		 367 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  62.6 
 
 		 367 aa  450  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  62.6 
 
 		 367 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  62.6 
 
 		 367 aa  450  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  62.6 
 
 		 367 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  62.6 
 
 		 367 aa  450  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  62.33 
 
 		 367 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0900  gamma-glutamyl kinase  61.75 
 
 		 367 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3150  gamma-glutamyl kinase  61.1 
 
 		 367 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3431  gamma-glutamyl kinase  61.64 
 
 		 367 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00966992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3284  gamma-glutamyl kinase  61.92 
 
 		 367 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3288  gamma-glutamyl kinase  61.1 
 
 		 367 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3301  gamma-glutamyl kinase  61.1 
 
 		 367 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000177494  hitchhiker  0.00343208 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0935  gamma-glutamyl kinase  63.01 
 
 		 367 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2953  gamma-glutamyl kinase  57.42 
 
 		 378 aa  391  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.839271  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0192  gamma-glutamyl kinase  55.65 
 
 		 370 aa  386  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.266887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  52.88 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  53.99 
 
 		 363 aa  359  5e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  50.96 
 
 		 367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  50.69 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  48.64 
 
 		 373 aa  345  5e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2272  gamma-glutamyl kinase  54.4 
 
 		 370 aa  342  5e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918384 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  48.26 
 
 		 373 aa  341  1e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  48.1 
 
 		 373 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  46.83 
 
 		 373 aa  331  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  46.7 
 
 		 390 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 		 376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  46.72 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  45.18 
 
 		 372 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  47.53 
 
 		 374 aa  317  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  46.72 
 
 		 372 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  46.03 
 
 		 373 aa  317  3e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  44.78 
 
 		 373 aa  315  6e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  46.7 
 
 		 378 aa  315  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  46.56 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  45.19 
 
 		 373 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 		 368 aa  308  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  46.15 
 
 		 373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  46.28 
 
 		 375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  45.33 
 
 		 376 aa  305  6e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 		 373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  47.8 
 
 		 374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 		 373 aa  302  7.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  46.45 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  45.05 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  46.43 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  44.48 
 
 		 372 aa  300  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  46.72 
 
 		 373 aa  299  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  45.88 
 
 		 372 aa  299  6e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 		 372 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  46.93 
 
 		 373 aa  298  8e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  46.03 
 
 		 375 aa  298  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  46.65 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  46.13 
 
 		 371 aa  296  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  42.47 
 
 		 371 aa  296  5e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  43.96 
 
 		 372 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  44.54 
 
 		 369 aa  294  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  45.88 
 
 		 374 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  44.51 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  44.78 
 
 		 376 aa  293  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  44.35 
 
 		 376 aa  293  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 		 373 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  46.15 
 
 		 374 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  43.68 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  44.96 
 
 		 376 aa  291  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 		 372 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  40 
 
 		 365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  42.19 
 
 		 374 aa  288  8e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  44.44 
 
 		 382 aa  288  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>