More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2794 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2794  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  373  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 177 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  42.94 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0139  transcriptional regulator, MerR family  38.82 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2779  MerR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3014  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.37376 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 342 aa  68.6  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 391 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 343 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 343 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  25.77 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 342 aa  62  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 144 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  35.24 
 
 		 135 aa  62  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 398 aa  61.2  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 290 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  33.93 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  29.5 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  31.52 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  33.93 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  38.3 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  38.3 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 390 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  35.29 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  29.13 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  40.3 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  36.76 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 390 aa  58.2  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  30.63 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 252 aa  57.8  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.61 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  32.29 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  29.75 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  34.12 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  37.25 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.43 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2318  MerR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2778  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0950  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  34.15 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.26 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.26 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  36.76 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0140  hypothetical protein  50.94 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  29.09 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.26 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  27.52 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  28 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  27.07 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0098  MerR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000252188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  30.93 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  32.95 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>