25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0897 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0897  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  687    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0873  hypothetical protein  38.11 
 
 		 362 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000116337  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00325  hypothetical protein  33.43 
 
 		 353 aa  166  6.9999999999999995e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.280662  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4376  hypothetical protein  40.82 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1812  hypothetical protein  35.64 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881235  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5422  hypothetical protein  39.18 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000729862  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  35.07 
 
 		 684 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6797  hypothetical protein  36.47 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126734  normal  0.776248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1729  hypothetical protein  30.19 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.821516  normal  0.131387 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2459  hypothetical protein  37.5 
 
 		 252 aa  102  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  30.82 
 
 		 1150 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2237  Methyltransferase type 12  25.83 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0110265  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.81 
 
 		 1044 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  25.63 
 
 		 2216 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  31.25 
 
 		 346 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0051  hypothetical protein  28.21 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0585  hypothetical protein  26.47 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2006  hypothetical protein  28 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  26.56 
 
 		 522 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  26.56 
 
 		 526 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 500 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 		 508 aa  47  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0219  hypothetical protein  31.68 
 
 		 389 aa  45.8  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  31.87 
 
 		 593 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>