More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9257 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9257  ABCB8; ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 8  100 
 
 
586 aa  1161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1962  ABC transporter related  56.38 
 
 
589 aa  649  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  66.21 
 
 
589 aa  756  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  50.26 
 
 
596 aa  580  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3967  ABC transporter related  45.28 
 
 
584 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.46 
 
 
566 aa  290  7e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  29.69 
 
 
566 aa  290  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.08 
 
 
556 aa  289  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.86 
 
 
598 aa  287  3e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  34.67 
 
 
666 aa  286  6e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.1 
 
 
597 aa  280  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.45 
 
 
595 aa  278  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  35.31 
 
 
620 aa  276  6e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  36.01 
 
 
578 aa  275  1e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  30.29 
 
 
579 aa  275  2e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  33.84 
 
 
601 aa  275  2e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  35.63 
 
 
575 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  31.15 
 
 
580 aa  270  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.57065e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  34.69 
 
 
592 aa  270  7e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  33.94 
 
 
594 aa  270  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.7 
 
 
574 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.7 
 
 
574 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  33.77 
 
 
636 aa  268  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  6.76834e-07  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  37.55 
 
 
618 aa  267  4e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  30.19 
 
 
582 aa  267  4e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  35.22 
 
 
584 aa  267  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  35.64 
 
 
567 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  32.99 
 
 
582 aa  266  7e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.45 
 
 
567 aa  266  8e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  35 
 
 
613 aa  266  9e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  31.78 
 
 
617 aa  265  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.00526e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  33.69 
 
 
623 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  33.22 
 
 
601 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  32.44 
 
 
615 aa  265  2e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.57 
 
 
577 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  36.2 
 
 
600 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  33.68 
 
 
597 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  31.69 
 
 
580 aa  265  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  31.62 
 
 
598 aa  263  5e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  34.14 
 
 
585 aa  263  6e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.96 
 
 
586 aa  262  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  36.95 
 
 
598 aa  262  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.42 
 
 
572 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  34.18 
 
 
576 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  31.45 
 
 
631 aa  262  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  29.82 
 
 
597 aa  261  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.2 
 
 
583 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.01 
 
 
575 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.15819e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  32.4 
 
 
572 aa  261  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.08 
 
 
618 aa  261  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.4 
 
 
572 aa  261  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  32.4 
 
 
572 aa  261  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  29.82 
 
 
597 aa  261  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.64 
 
 
596 aa  261  3e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  36.11 
 
 
620 aa  261  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  35.75 
 
 
609 aa  261  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.64 
 
 
585 aa  260  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  33.39 
 
 
596 aa  260  4e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  29.57 
 
 
594 aa  261  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  32.55 
 
 
584 aa  260  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  33.39 
 
 
588 aa  259  7e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  31.89 
 
 
618 aa  259  8e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  32.44 
 
 
590 aa  259  9e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.58 
 
 
600 aa  259  9e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.98 
 
 
581 aa  259  9e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  36.51 
 
 
581 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.37 
 
 
578 aa  259  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  32.06 
 
 
596 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  31.65 
 
 
671 aa  257  4e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  29.9 
 
 
660 aa  256  1e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.46 
 
 
571 aa  254  2e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  34.33 
 
 
610 aa  255  2e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.01 
 
 
587 aa  255  2e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  33.72 
 
 
649 aa  254  2e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  33.99 
 
 
663 aa  254  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  31.28 
 
 
572 aa  254  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  34.27 
 
 
578 aa  254  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  35.15 
 
 
597 aa  254  4e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  28.6 
 
 
626 aa  254  4e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  31.05 
 
 
607 aa  254  4e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.15 
 
 
586 aa  254  4e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  33.14 
 
 
672 aa  254  4e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  33.33 
 
 
640 aa  254  4e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.15 
 
 
586 aa  254  4e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  33.79 
 
 
575 aa  253  5e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1722  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.56 
 
 
594 aa  253  5e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.031974 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.2 
 
 
583 aa  253  6e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  37.2 
 
 
611 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  32.66 
 
 
608 aa  253  8e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  45.22 
 
 
595 aa  252  1e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0733  ABC transporter related  33.6 
 
 
605 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  37 
 
 
611 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  35.29 
 
 
601 aa  252  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  34.69 
 
 
582 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.09 
 
 
580 aa  252  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.35 
 
 
586 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.35 
 
 
586 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.1 
 
 
571 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  35.02 
 
 
619 aa  251  3e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  30.87 
 
 
468 aa  251  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>