More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6249 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  71.94 
 
 
148 aa  207  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  68.57 
 
 
187 aa  203  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  69.29 
 
 
159 aa  203  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  65.47 
 
 
157 aa  191  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  64.75 
 
 
149 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  58.27 
 
 
148 aa  176  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  55 
 
 
149 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
170 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  46.04 
 
 
153 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
170 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  46.76 
 
 
170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  46.04 
 
 
153 aa  123  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 
153 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 
160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  42.54 
 
 
151 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.14 
 
 
151 aa  114  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  41.91 
 
 
157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 
153 aa  114  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 
162 aa  114  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  44.53 
 
 
150 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 
165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  45.86 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  41.48 
 
 
155 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  41.48 
 
 
155 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 
152 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  41.01 
 
 
151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 
151 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  42.65 
 
 
155 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  42.75 
 
 
151 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  44.12 
 
 
173 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
151 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  44.36 
 
 
158 aa  105  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
160 aa  104  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 
158 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
153 aa  103  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  44.12 
 
 
157 aa  103  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  41.91 
 
 
167 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
151 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 
151 aa  101  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  43.94 
 
 
162 aa  101  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 
158 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  40.15 
 
 
152 aa  97.1  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3073  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379394  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3316  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3294  transcriptional regulator, AsnC family  36.23 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 
152 aa  94  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
163 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
163 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  36.64 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  30.22 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
163 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  37.86 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 
144 aa  91.3  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
173 aa  90.5  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
168 aa  90.1  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 
164 aa  90.1  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
145 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  43.38 
 
 
162 aa  89.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
145 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  36.96 
 
 
152 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  39.1 
 
 
164 aa  88.2  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  39.1 
 
 
164 aa  88.2  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
145 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  35.38 
 
 
171 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  35.38 
 
 
150 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  35.38 
 
 
150 aa  87  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  35.38 
 
 
150 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  35.38 
 
 
150 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  35.38 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 
165 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  36.76 
 
 
162 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
162 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  34.56 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
162 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  34.56 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  45 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  45 
 
 
150 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 
153 aa  84  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  33.85 
 
 
150 aa  84  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3196  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  45 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2972  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  28.68 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2928  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  35.07 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  27.94 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>