88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1703 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1793  NlpBDapX family lipoprotein  86.03 
 
 
365 aa  664  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  3.6858e-09  hitchhiker  1.80087e-08 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2666  NlpB/DapX family lipoprotein  86.58 
 
 
365 aa  664  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2589  NlpB/DapX family lipoprotein  86.03 
 
 
365 aa  664  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  7.86749e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1703  NlpB/DapX family lipoprotein  100 
 
 
365 aa  749  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  3.63681e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1880  lipoprotein-34 NlpB  87.4 
 
 
365 aa  671  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2551  NlpB/DapX family lipoprotein  86.03 
 
 
365 aa  664  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  6.48805e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2339  NlpB/DapX family lipoprotein  85.75 
 
 
365 aa  662  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014226  hitchhiker  2.93311e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1657  NlpB/DapX family lipoprotein  85.48 
 
 
365 aa  660  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297866  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2411  NlpB/DapX family lipoprotein  86.58 
 
 
365 aa  669  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00389139  hitchhiker  0.00606094 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1865  NlpB/DapX family lipoprotein  60.82 
 
 
365 aa  491  1e-138  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  8.07402e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2429  NlpB/DapX family lipoprotein  60.86 
 
 
373 aa  487  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.29618e-07  hitchhiker  3.81817e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2178  NlpB/DapX family lipoprotein  60.05 
 
 
371 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.19579e-06  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1849  NlpB/DapX family lipoprotein  57.49 
 
 
373 aa  457  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00809428  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1981  NlpB/DapX family lipoprotein  57.65 
 
 
365 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.95989e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1736  NlpBDapX lipoprotein  56.28 
 
 
372 aa  441  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.22629e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1907  lipoprotein-34 NlpB  57.95 
 
 
354 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00617793  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2477  NlpBDapX lipoprotein  30.75 
 
 
368 aa  185  1e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02135  lipoprotein-34 NlpB  28.21 
 
 
367 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00349153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1140  lipoprotein  28.92 
 
 
345 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1861  NlpB/DapX family lipoprotein  24.18 
 
 
374 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127123  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3178  lipoprotein  29.22 
 
 
345 aa  106  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0463443  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2854  lipoprotein  25.46 
 
 
344 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2633  lipoprotein  25.15 
 
 
344 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2747  lipoprotein  25.15 
 
 
344 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2722  lipoprotein  25.15 
 
 
344 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.12688  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2681  lipoprotein  25.15 
 
 
344 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1073  lipoprotein  25.93 
 
 
346 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2973  lipoprotein  25.23 
 
 
344 aa  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.500746 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02369  lipoprotein  24.54 
 
 
344 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2624  lipoprotein  24.54 
 
 
344 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1192  NlpBDapX family lipoprotein  24.54 
 
 
344 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1199  lipoprotein  24.54 
 
 
344 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2609  lipoprotein  24.54 
 
 
344 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02331  hypothetical protein  24.54 
 
 
344 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2759  lipoprotein  24.54 
 
 
344 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3699  lipoprotein  24.23 
 
 
344 aa  99  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2983  lipoprotein  25.38 
 
 
346 aa  99.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2849  lipoprotein  24.23 
 
 
344 aa  98.6  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3508  lipoprotein  24.13 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3133  lipoprotein  27.44 
 
 
352 aa  97.1  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1248  lipoprotein  27.44 
 
 
352 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1363  lipoprotein  27.44 
 
 
352 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.206221  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2378  lipoprotein  26.39 
 
 
350 aa  93.6  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1737  lipoprotein  26.98 
 
 
339 aa  92.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3182  putative lipoprotein  23.54 
 
 
389 aa  89.7  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0809995  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002794  NlpB lipoprotein component of the protein assembly complex  26.33 
 
 
339 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03186  lipoprotein  25.91 
 
 
339 aa  82  2e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1084  NlpBDapX family lipoprotein  21.47 
 
 
398 aa  68.6  2e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170875  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1069  hypothetical protein  20.88 
 
 
413 aa  67.4  4e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0988  NlpBDapX family lipoprotein  21.2 
 
 
398 aa  67  5e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359862  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1146  hypothetical protein  21.2 
 
 
398 aa  66.6  7e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0438045  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1105  transmembrane protein  22.11 
 
 
411 aa  64.3  3e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  23.98 
 
 
364 aa  62.4  1e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0847  NlpBDapX lipoprotein  23.72 
 
 
374 aa  60.8  3e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165438 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  22.93 
 
 
367 aa  59.7  8e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5090  NlpB/DapX family lipoprotein  22.14 
 
 
385 aa  57.4  3e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.010697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  22.42 
 
 
383 aa  55.5  1e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1726  putative lipoprotein  22.04 
 
 
408 aa  53.5  5e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1749  putative lipoprotein  22.93 
 
 
408 aa  53.5  6e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1905  hypothetical protein  22.93 
 
 
401 aa  53.1  7e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1586  putative lipoprotein  22.68 
 
 
379 aa  52  2e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1539  NlpBDapX lipoprotein  22.12 
 
 
374 aa  50.8  3e-05  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2547  putative lipoprotein  25.43 
 
 
379 aa  50.1  6e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00204284  normal  0.0198608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1444  putative exported lipoprotein  21.79 
 
 
411 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210161  normal  0.0324872 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0842  uncharacterized lipoprotein  20.71 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00443208  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0986  uncharacterized lipoprotein  20.71 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00100518  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1426  putative lipoprotein  22.61 
 
 
382 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.600004  normal  0.242531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1523  putative exported lipoprotein  30.12 
 
 
410 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.196689 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1770  uncharacterized lipoprotein-like protein  31.33 
 
 
401 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.402849  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0923  NlpBDapX family lipoprotein  21.65 
 
 
362 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1009  NlpB/DapX family lipoprotein  22.02 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1369  uncharacterized lipoprotein-like protein  35.71 
 
 
402 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3006  putative lipoprotein  21.35 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.169613  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2676  putative exported lipoprotein  28.28 
 
 
409 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439615  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  23.67 
 
 
386 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1409  uncharacterized lipoprotein-like protein  35.71 
 
 
402 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2621  hypothetical protein  22.5 
 
 
395 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1004  uncharacterized lipoprotein-like  33.93 
 
 
402 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1462  uncharacterized lipoprotein-like protein  33.93 
 
 
402 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1486  uncharacterized lipoprotein-like protein  33.93 
 
 
402 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.749081  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4626  uncharacterized lipoprotein-like  33.93 
 
 
403 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448187  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2578  putative lipoprotein  33.93 
 
 
401 aa  43.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0891208  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2475  NlpBDapX lipoprotein  22.73 
 
 
346 aa  43.1  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1907  putative lipoprotein  21.79 
 
 
418 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0976  putative lipoprotein  33.93 
 
 
408 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0190  putative lipoprotein  33.93 
 
 
408 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1524  putative lipoprotein  33.93 
 
 
408 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1080  putative lipoprotein  33.93 
 
 
410 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>