More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4131 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 
277 aa  573  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  43.8 
 
 
279 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  47.52 
 
 
234 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  43.24 
 
 
228 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  43.24 
 
 
228 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  44.81 
 
 
232 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  40.77 
 
 
231 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  41.45 
 
 
285 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  40.54 
 
 
233 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  38.87 
 
 
276 aa  178  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  44.12 
 
 
232 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  43.84 
 
 
229 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  44.97 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  45.54 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.66 
 
 
224 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  42.79 
 
 
228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  43.69 
 
 
226 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  40.76 
 
 
238 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  44.62 
 
 
229 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  39.81 
 
 
691 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  39.81 
 
 
232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  39.81 
 
 
242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  39.81 
 
 
232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  39.34 
 
 
232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  39.34 
 
 
242 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  39.34 
 
 
242 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  36.84 
 
 
261 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.61 
 
 
225 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.95 
 
 
276 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.62 
 
 
234 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.62 
 
 
239 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.13 
 
 
234 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  41.38 
 
 
225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.17 
 
 
231 aa  155  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.44 
 
 
227 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  37.44 
 
 
227 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.44 
 
 
227 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  40.49 
 
 
242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.1 
 
 
225 aa  153  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  39.13 
 
 
241 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  39.42 
 
 
232 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  39.2 
 
 
220 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.38 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.43 
 
 
245 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  40.43 
 
 
245 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.43 
 
 
245 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  40 
 
 
261 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.5 
 
 
230 aa  143  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  39.36 
 
 
243 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.13 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  42.57 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.98 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.85 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.51 
 
 
246 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.56 
 
 
234 aa  139  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  34.56 
 
 
234 aa  139  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5977  ThiJ/PfpI  37.5 
 
 
228 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  38.69 
 
 
228 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  38.69 
 
 
228 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.51 
 
 
231 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.34 
 
 
227 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  35.29 
 
 
212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.32 
 
 
227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.39 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.25 
 
 
231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.24 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  38.36 
 
 
227 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10051  hypothetical protein  40.85 
 
 
187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  34.01 
 
 
228 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  34.01 
 
 
228 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  35.42 
 
 
238 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  37.38 
 
 
233 aa  126  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  36.68 
 
 
214 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  40.4 
 
 
201 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.83 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  38.76 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.17 
 
 
284 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  31.73 
 
 
326 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.18 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  34.67 
 
 
284 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.67 
 
 
284 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.73 
 
 
240 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  33.16 
 
 
297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.2 
 
 
210 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  36.91 
 
 
198 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  34.13 
 
 
222 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.85 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.26 
 
 
198 aa  96.3  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1577  ThiJ/PfpI  33.69 
 
 
209 aa  94.7  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 
338 aa  92.8  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2559  ThiJ/PfpI  41.73 
 
 
148 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30 
 
 
199 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  32.24 
 
 
316 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.53 
 
 
199 aa  89  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  31.16 
 
 
218 aa  88.6  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 
209 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  29.95 
 
 
202 aa  86.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  32.99 
 
 
199 aa  85.9  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  25 
 
 
241 aa  85.9  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>