285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0012 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  100 
 
 
81 aa  171  2e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  92.59 
 
 
81 aa  159  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  86.42 
 
 
81 aa  152  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  86.42 
 
 
81 aa  152  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  1.82945e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  85.19 
 
 
81 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  1.7124e-08 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  86.42 
 
 
81 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  86.42 
 
 
81 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23371e-06 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  86.25 
 
 
81 aa  150  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.21499e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  86.42 
 
 
81 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  86.42 
 
 
81 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  86.42 
 
 
81 aa  150  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  8.78962e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  86.42 
 
 
81 aa  150  6e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  85.19 
 
 
81 aa  150  6e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  85.19 
 
 
81 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  80.25 
 
 
81 aa  146  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  82.72 
 
 
99 aa  144  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  71.25 
 
 
86 aa  131  2e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  71.6 
 
 
81 aa  131  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  72.5 
 
 
81 aa  129  1e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  72.5 
 
 
81 aa  129  1e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  72.5 
 
 
81 aa  129  1e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  72.5 
 
 
81 aa  129  1e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  72.5 
 
 
81 aa  129  1e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  72.5 
 
 
81 aa  129  1e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  72.5 
 
 
81 aa  129  1e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  72.5 
 
 
81 aa  129  1e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  72.5 
 
 
81 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  71.25 
 
 
111 aa  127  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  71.25 
 
 
111 aa  127  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  71.25 
 
 
111 aa  127  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  71.25 
 
 
111 aa  127  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  71.25 
 
 
111 aa  127  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  70.37 
 
 
84 aa  127  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  70.37 
 
 
84 aa  127  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  70.37 
 
 
84 aa  127  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  72.15 
 
 
81 aa  127  7e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  75.68 
 
 
82 aa  123  8e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  74.32 
 
 
82 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  67.5 
 
 
81 aa  121  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2495  sulfur transfer protein SirA  71.05 
 
 
82 aa  120  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  66.25 
 
 
81 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  67.5 
 
 
80 aa  118  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  64.2 
 
 
81 aa  117  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  68.83 
 
 
83 aa  117  8e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  72 
 
 
83 aa  116  1e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  68.12 
 
 
79 aa  113  9e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  69.57 
 
 
78 aa  112  1e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  61.04 
 
 
81 aa  110  8e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  50.68 
 
 
86 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  49.32 
 
 
86 aa  81.6  3e-15  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  50 
 
 
83 aa  82  3e-15  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  47.37 
 
 
82 aa  81.6  4e-15  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  52.17 
 
 
84 aa  80.9  5e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  46.25 
 
 
83 aa  80.5  8e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  52.94 
 
 
80 aa  80.1  9e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  52.94 
 
 
79 aa  79.7  1e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  52.94 
 
 
79 aa  79.3  2e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  49.33 
 
 
85 aa  78.6  2e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
80 aa  78.2  4e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
80 aa  77.8  4e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  42.68 
 
 
97 aa  78.2  4e-14  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
80 aa  77.8  4e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  50.68 
 
 
77 aa  77.4  5e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  51.47 
 
 
84 aa  77.4  6e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  51.47 
 
 
83 aa  77.4  7e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  44.93 
 
 
81 aa  76.3  1e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  40 
 
 
76 aa  66.6  1e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  42.03 
 
 
78 aa  65.5  2e-10  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  33.8 
 
 
80 aa  65.1  3e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.14 
 
 
831 aa  63.2  1e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  36.99 
 
 
75 aa  62.8  2e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  36.76 
 
 
76 aa  61.6  4e-09  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  38.81 
 
 
85 aa  58.9  2e-08  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  33.33 
 
 
85 aa  58.9  2e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  34.78 
 
 
79 aa  58.5  3e-08  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  33.8 
 
 
76 aa  58.5  3e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  33.33 
 
 
77 aa  58.2  3e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  34.29 
 
 
213 aa  58.5  3e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  34.78 
 
 
79 aa  58.5  3e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  34.29 
 
 
79 aa  58.5  3e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  34.29 
 
 
79 aa  57.8  4e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.29 
 
 
817 aa  58.2  4e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  34.29 
 
 
76 aa  58.2  4e-08  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  30.56 
 
 
77 aa  58.2  4e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  30.67 
 
 
76 aa  58.2  4e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  8.19157e-05  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  35.44 
 
 
81 aa  57.8  5e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  38.03 
 
 
75 aa  57.4  7e-08  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.78 
 
 
938 aa  57.4  7e-08  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  34.29 
 
 
79 aa  57  8e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  36.76 
 
 
79 aa  56.2  1e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  39.13 
 
 
102 aa  56.6  1e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  31.88 
 
 
75 aa  56.2  1e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  35.29 
 
 
72 aa  55.5  2e-07  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  33.82 
 
 
75 aa  55.8  2e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  37.84 
 
 
78 aa  55.8  2e-07  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  31.88 
 
 
79 aa  55.5  3e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  30.99 
 
 
75 aa  55.1  3e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  30.67 
 
 
83 aa  55.1  3e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  33.82 
 
 
78 aa  54.7  4e-07  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  6.89982e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  37.31 
 
 
78 aa  54.7  4e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>